La iglesia de San Giovanni Battista representa uno de los más bellos y mejor conservados ejemplos del estilo románico de Puglia en Matera. La estructura original se remonta a años inmediatamente anteriores al siglo XIII y fue completada en 1233, en este período la iglesia era conocida como Santa María la Nova y era un lugar de acogida para los penitentes agustinos de Accon. Cuando las monjas se mudaron, a finales del siglo XV, la iglesia fue abandonada y permaneció sin usar hasta 1695 cuando Monseñor del Ryos sancionó su reapertura para el culto, dándole el nombre por el que hoy la conocemos. Se accede a ella a través de lo que originalmente era la fachada lateral, la principal se incorporó en 1610 en la construcción del edificio adyacente que iba a servir de hospital. Destacan el portal finamente decorado, un rosetón adornado con refinados ornamentos y una estatua de San Juan Bautista hecha de piedra policromada. A la derecha del portal la fachada correspondiente al ábside tiene una estructura muy cercana a la original. El elemento que más caracteriza a esta iglesia es la arquitectura interior típicamente medieval, se puede admirar gracias a la iniciativa del abad Marcello Morelli que entre 1920 y 1930 decidió eliminar la cubierta del siglo XVIII. La iglesia tiene forma de cruz latina y consta de 3 naves divididas por pilares cuatrilobulados; sobre ellos descansan medias columnas y capiteles con decoraciones muy elaboradas y muy variadas. De los pilares se desarrollan grandes arcos que forman bóvedas cruzadas.
