La presencia en la meseta de la cumbre del Matese de nada menos que tres lagos (Matese, Gallo y Letino) ha dado lugar a un maravilloso hábitat natural; el valle en el que se encuentran es uno de los más bellos de los Apeninos y, al mismo tiempo, uno de los mejor conservados en términos de paisaje. Esto ha llevado a su designación como Zona de Protección Especial en virtud de la Directiva 79/409/CEE. El lago Matese, el lago kárstico más alto de Italia, recoge las aguas del Monte Miletto y de la Gallinola y es importante por su abundante flora lacustre de juncos y carrizales que hacen posible que una gran variedad de aves acuáticas se detengan y aniden. Su importancia radica tanto en el aspecto hídrico, como alimentador de acuíferos subterráneos y ríos, como en el aprovechamiento de la energía hidroeléctrica.
Los lagos de Letino y Gallo se crearon embalsando el curso de los ríos Lete y Sava y aún hoy se utilizan con fines hidroeléctricos. También es interesante el biotopo de Le Mortine, convertido en Oasis del WWF, para el que se ha formalizado una solicitud de creación de una Zona de Protección Especial. Los cormoranes (Phaalcrocorax carbo) utilizan los bosques mesófilos del Oasis como dormitorio nocturno, y al atardecer hay unos 300 de ellos descansando en los árboles, mientras que las fochas (Fulica atra), especie residente todo el año en la zona, superan el millar, a las que se suman los individuos invernantes procedentes de los países del noreste de Europa. También cabe destacar la parada invernal de las garzas blancas (Casmerodius albus), que son más de diez en sus dormideros nocturnos en los altos árboles que rodean el embalse.
