Mezarlar, şimdi çatısı olmayan anıtsal bir harabe olan eski Aziz Francis Kilisesi'nin iç kısmından alt portikoya taşınmış ve 1659 yılında burada yeniden bir araya getirilmiştir. Bugünkü haliyle revak, 1850 yılında mühendis Filippo Bandini tarafından tamamlanan neo-Gotik bir rekonstrüksiyonun sonucudur. Pandolfo III'ün ilk eşi Paola Bianca Malatesti'nin mezarı, özenle hazırlanmış lahitin kapağında yatan merhumun görüntüsünü taçlandıran heykelcikler, kornişler, asma kemerler ve burgulu sütunlarla süslenmiştir. Maestro Filippo di Domenico'nun Venedik'ten ithal ettiği geç dönem Gotik heykel sanatının özgün bir başyapıtıdır. Daha mütevazı olan Bonetto da Castelfranco'nun mezarı ise Sigismondo Malatesti tarafından sadık hekiminin kalıntılarını barındırması için yaptırılmıştır. Portalin karşı tarafında ise, büyük olasılıkla tasarımı Leon Battista Alberti'ye emanet eden oğlu Sigismondo tarafından yaptırılan Pandolfo III Malatesti'nin Rönesans mezarı yer almaktadır. Anıtsal kompleksin tamamında yapılan son restorasyon çalışmaları sırasında, Pandolfo III'ün mumyalanmış bedeni beklenmedik bir şekilde bulunmuştur.
