No bijušās Svētā Franciska baznīcas iekštelpām, kas tagad ir monumentālas drupas bez jumta, kapenes tika pārvietotas uz apakšportiku un 1659. gadā tur atkal saliktas. Tomēr mūsdienu veidolā portiks ir neogotikas rekonstrukcijas rezultāts, ko 1850. gadā pabeidza inženieris Filippo Bandini. Pandolfo III pirmās sievas Paolas Biankas Malatesti kapavietu rotā statuetes, koraļļi, piekaramie arkas un vītas kolonnas, kas vainago mirušās tēlu, kurš guļ uz sarežģītā sarkofāga vāka. Tas ir autentisks Venēcijas izcelsmes vēlajā gotikā veidots maestro Filippo di Domeniko tēlniecības šedevrs. Pieticīgāks ir Bonetto da Castelfranco kapenes, ko pasūtīja Sigismondo Malatesti, lai glabātu sava uzticamā ārsta mirstīgās atliekas. Portāla pretējā pusē atrodas Pandolfo III Malatesti renesanses kapenes, ko pasūtījis viņa dēls Sigismondo, kurš, visticamāk, uzticēja projekta izstrādi Leonam Battista Alberti. Neseno restaurācijas darbu laikā visā monumentālajā kompleksā negaidīti tika atrasts Pandolfo III mumificētais ķermenis.
