O Museo Lapidario Estense é o primeiro museo público establecido en Módena. A súa fundación é debido ao Duque Francis IV de Austria-Este, que o 31 de Marzo de 1828 decretou o seu nacemento co nome da Modenese Lapidary Museo. El foi inspirado por ilustres exemplos como o Maffeiano Lapidary Museo en Verona (1738), ou a lapidary Galería na Chiaramonti Museo do Vaticano (1800-1823), pero con un peculiar cívica vocación destinadas a glorificar o ilustre pasado da cidade dende a súa orixe como unha colonia Romana de Mutina.
O núcleo inicial consistía en algunhas pezas xa conserva no Palacio dos doges en Módena, adquiridos por Este doutras coleccións de libros ou como escavación atopa desde o Ducal territorios de Brescello e Novellara. Desde o inicio, os cidadáns, comezando cos representantes do clero e da nobreza, comprometeuse a doar materiais para as súas propiedades e finanzas museo, que nun par de anos rexistrou un aumento significativo, que está certificado por dúas inscricións conmemorativa dos seus benfeitores (1828 e 1830) aínda está preservado. O científico catálogo publicado en 1830 polo seu primeiro director, Carlo Malmusi, establecen os principios que inspiraron a institución:" para servir arqueoloxía "," para a memoria do ilustre antepasados "e" para estudar o progreso do local escultura ". Ademais para os achados da época romana, en realidade, el saudou inmediatamente no memorias e arche enterro durante séculos, ata que a finais do século Xvii, foi colocado no adro da igrexa, no lado sur da Catedral ou a outros edificios sagrados de Módena e Reggio Emilia: unha práctica xurdiu mesmo na era da protoumanistica, en base a preto de Bolonia, en memoria de aqueles cidadáns que foron distinguidos, sobre todo, no campo do dereito e medicina.
Despois da unificación de Italia, o Museo Lapidario adquiriu novos espazos baixo a dirección de Arsenio Crespellani, autor dun novo catálogo en 1897. O pasado museográfico arranxo foi que de Cesare Giorgi de 1938, recuperado con coidado traballo de restauración, a finais do século pasado.