Įsikūręs ant Mondego upės krantų, "Mosteiro de Santa Cruz" yra vienas seniausių ir svarbiausių Koimbros paminklų, įkurtas 1131 m.Šv. D. Afonso Henriques, pirmasis Portugalijos karalius, čia dalyvavo religinėse tarnybose, kad sugrįžtų iš savo krikščioniškojo Rekonquesto kovų. Galbūt dėl to jis pasirinko jį savo amžinam poilsiui, kaip ir jo sūnus D. Sancho I.
Santa Krusas buvo pirmųjų Viduramžių studijų Portugalijoje lopšys, kuris savo edukaciniais veiksmais sustiprintų kylančią karališkąją galią. Būtent tarp jos sienų buvo vienas iš universaliausių dvylikto ir trylikto amžiaus Vakarų kultūros veikėjų, Šv. Antanas, bažnyčios daktaras, gilino teologinius tyrimus ir didžiules žinias apie šventąjį raštą, kuris yra akivaizdus jo pamoksluose.
XVI a.bažnyčią, vienuolyną ir koplyčias perstatė Diogo De Boitaca, įsitvirtinusi kaip vienas gražiausių Portugalijos meninio renesanso kūrinių.
Iki šios dienos, nepaisant Žmogaus ir laiko padarytos žalos, išsaugomos puikios detalės: fasadas, sakykla ir karališkieji kapai, tylos vienuolynas, vienuolyno bareljefai ir zakristijos paveikslai.