Het vloermozaïek van de kathedraal is van aanzienlijke omvang, strekt zich uit over de gehele lengte van het hoofdschip en bestaat uit ongeveer 600.000 polychrome tesserae van lokale kalksteen samenstelling. Het stelt de Levensboom voor en werd in 1163 in opdracht van bisschop Gionata gemaakt door de monnik Pantaleone van de abdij van S. Nicola di Casale in Otranto, die het meesterwerk in 1165 voltooide.Een eerste bijzonderheid van het mozaïek is het feit dat de naam van de auteur erop is gegraveerd, in overeenstemming met de hoofdingang, een feit dat op zijn minst ongebruikelijk was voor die tijd en waarschijnlijk te danken is aan het voorrecht om de kunstenaar eer te bewijzen als dank voor het prachtige succes van het werk.Zoals gezegd is de betekenis die de meeste deskundigen aan de voorstelling geven die van de Levensboom, maar er zijn controversiële theorieën en er is nooit een conclusie bereikt die alle stromingen bevredigt, zodat er een sluier van mysterie rond het werk blijft hangen.Wat wel duidelijk is, is dat zich rond de boom, die zich uitstrekt van de ingang tot het priesterkoor, een groot aantal scènes uit het Oude Testament ontvouwt, die de moeizame weg symboliseren die de mens aflegt om zijn zonden te overwinnen en eeuwig heil te bereiken: de gebeurtenissen van Adam en Eva, die van Kaïn en Abel, de conceptie van de hel en het Paradijs. Er is geen gebrek aan mythologische en historische verwijzingen, zoals die naar Koning Arthur en Alexander de Grote. Zeer opvallend is ook de weergave van de twaalf maanden van het jaar waaraan een cirkelvormig deel is gewijd, alsmede de weergave van de relatieve seizoensarbeid.Uit de rijkdom en verscheidenheid van de aanwezige elementen en symbolen blijkt eens te meer dat Otranto altijd een ontmoetingsplaats is geweest tussen culturen, volkeren en verschillende artistieke en culturele stromingen. De geografische ligging van de stad heeft de ontmoeting en uitwisseling tussen West en Oost vergemakkelijkt, waarbij de plaats vaak werd blootgesteld aan aanvallen en invasies die de eigen cultuur meer dan bevorderden, opdrongen. Wat na duizenden jaren geschiedenis overblijft is een reeks schatten, afdrukken, tekenen van de doortocht van verschillende volkeren, die de schatten van Otranto ook en vooral in artistiek opzicht hebben verrijkt.