Podlahová mozaika katedrály je značne veľká, tiahne sa po celej dĺžke hlavnej lode a pozostáva z približne 600 000 polychrómovaných teser miestneho vápencového zloženia. Zobrazuje Strom života a vznikla na objednávku biskupa Gionata ešte v roku 1163 a realizoval ju mních Pantaleone z opátstva S. Nicola di Casale v Otrante, ktorý dielo dokončil v roku 1165.Prvou zvláštnosťou mozaiky je skutočnosť, že je na nej vyryté meno jej autora, ktoré korešponduje s hlavným vchodom, čo je na tú dobu prinajmenšom nezvyčajné a pravdepodobne to bolo spôsobené privilégiom vyjadriť umelcovi uznanie ako poďakovanie za veľkolepý úspech diela.Ako už bolo spomenuté, väčšina odborníkov pripisuje vyobrazeniu význam Stromu života, ale existujú kontroverzné teórie a nikdy sa nedospelo k záveru, ktorý by uspokojil všetky názorové prúdy, takže dielo zostáva zahalené rúškom tajomstva.Isté však je, že okolo stromu, ktorý sa tiahne od vchodu do presbytéria, sa odvíja množstvo výjavov zo Starého zákona, ktoré symbolizujú strastiplnú cestu človeka k prekonaniu hriechov a dosiahnutiu večnej spásy: udalosti Adama a Evy, udalosti Kaina, Ábela, počatie pekla a raja. Nechýbajú ani mytologické a historické odkazy, napríklad na kráľa Artuša a Alexandra Veľkého. Veľmi nápadné je aj zobrazenie dvanástich mesiacov v roku, ktorým je venovaná okrúhla časť, ako aj znázornenie relatívnych sezónnych prác.Bohatstvo a rozmanitosť prítomných prvkov a symbolov je ďalším dôkazom toho, že Otranto vždy predstavovalo miesto stretávania kultúr, národov a rôznych umeleckých a kultúrnych prúdov. Geografická poloha, ktorej sa mesto tešilo, uľahčovala stretávanie a výmenu medzi Západom a Východom, pričom často vystavovala toto miesto útokom a inváziám, ktoré viac ako uprednostňovali, vnucovali vlastnú kultúru. Po tisícročiach histórie tu zostal rad pokladov, odtlačkov, znakov prechodu rôznych národov, ktoré obohatili poklady Otranta aj a predovšetkým z umeleckého hľadiska.
