Il sottomarino di costruzione britannica Lembit, che pesa 600 tonnellate, è il fulcro del nuovo museo. Costruito nel 1936 per la marina estone, Lembit servì nella seconda guerra mondiale sotto la bandiera sovietica. È rimasto in servizio per 75 anni, essendo il più vecchio sottomarino del mondo ancora in uso, fino a quando è stato trascinato a terra nel 2011. Nonostante la sua lunga storia, Lembit è ancora in ottime condizioni e offre un assaggio dell'arte tecnologica degli anni '30.
Un'altra eccitante attrazione è una replica in scala reale dello Short Type 184, un idrovolante britannico precedente alla seconda guerra mondiale, che fu usato anche dalle forze armate estoni. Lo Short Type 184 si è guadagnato un posto nella storia militare per essere stato il primo aereo in assoluto ad attaccare una nave nemica con un siluro lanciato dall'aria. Poiché nessuno degli idrovolanti originali è sopravvissuto, la replica nel porto degli idrovolanti è l'unica rappresentazione a grandezza naturale dell'aereo in tutto il mondo.
I simulatori che simulano un volo sopra Tallinn, il viaggio intorno al mondo nel sottomarino giallo, la navigazione nella baia di Tallinn fanno di questo museo un paradiso per i bambini o per gli adulti avventurosi.
Il porto degli idrovolanti opera in hangar architettonicamente unici costruiti quasi un secolo fa, nel 1916 e 1917, come parte della fortezza marittima di Pietro il Grande. Questi hangar sono le prime strutture a guscio in cemento armato al mondo di così grandi dimensioni. Charles Lindbergh, l'uomo che eseguì il primo volo da solo attraverso l'Oceano Atlantico, atterrò qui nel 1930.
Nell'area esterna i visitatori possono visitare una collezione di navi storiche, compresa la Suur Tõll, la più grande rompighiaccio a vapore d'Europa.
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