O Museo Municipal de Palazzo Te está situado na habitacións no piso superior. Hai catro coleccións en exposición:
Gonzaghesca Sección A sección está composta de materiais relacionados principalmente para a historia de mantua en idade gonzaga (1328-1707): unha Colección de Moedas consiste 595 moedas producidas pola casa da moeda de Mantua, unha colección de conos e socos, a vella conxunto de pesos e medidas do Estado de Mantua, e unha colección de 62 medallas de Gonzaga familia, e de ilustres personaxes mantovani.
Doazón " Arnoldo Mondadori" A sección consta de dezanove pinturas por Federico Zandomeneghi (1841-1917), e por trece, por Armando Spadini (1883-1925), recollidos por Arnoldo Mondadori e doados en 1974 polos herdeiros do editor de mantuan orixe.
Exipcia colección " Giuseppe Acerbi " Giuseppe Acerbi (1773-1846), Cónsul Xeral de Austria en Exipto, participou en 1829, en algunhas fases do famoso arqueolóxico expedición levou por Jean François Champollion. Constituíu unha importante colección de materiais arqueolóxicos, 500 pezas que en 1840 el doou á cidade de Mantua. Agora, a súa recollida é totalmente en exposición no Palazzo Te.
Mesopotamia colección " Ugo Sissa" A colección formada por Ugo Sissa, arquitecto e pintor Mantuan (1913-1980), arquitecto-xefe en Bagdad entre 1953 e 1958, consta de preto de 250 pezas de arte Mesopotámica encontros entre o final do sexto milenio antes de cristo e o fin do primeiro milenio DC.
