O Grande Conselho da cidade fundou o Museu Arqueológico em 1561. Durante o século XIX, a coleção de lápides Romanas foi enriquecida com as de P. Vimercati Sozzi e G. Mantovani e, mais tarde, com as descobertas da Superintendência arqueológica da Lombardia. A seção pré-histórica inclui peças do período Neolítico até a Idade do ferro do território de Bérgamo. Particularmente relevantes são as urnas cinerárias do cemitério golasecca em Brembate Di Sotto. Várias peças de locais funerários são artefatos gálicos e objetos da cultura romana. A seção lapidária mostra lápides romanas que testemunham a presença de famílias celtas indígenas e cidadãos romanos que haviam se mudado para o norte. Na seção dedicada à cidade, contamos a história de Bérgamo, desde o assentamento protohistórico de Golasecca até a Prefeitura Romana. Os afrescos em um domus podem ser datados entre o final do primeiro e segundo séculos D. C. As estátuas atraem a atenção por sua alta qualidade e por sua antiguidade (I século A. C.). A seção medieval superior mostra peças Góticas e lombardas, incluindo um notável Arsenal guerreiro. Algumas cruzes de folhas de ouro são excelentes obras de arte.
