Muzej je izgrađen između 1933. i 1939. kako bi udomio dva gigantska broda koji su pripadali caru Kaliguli (37.-41. poslije Krista) izvađena iz voda jezera između 1929. i 1931. Stoga je to bio prvi muzej u Italiji koji je izgrađen u funkciji sadržaja, dva trupa dimenzija m. 71,30 x 20 i m. 73 x 24, nažalost uništen u požaru 1944. Ponovno otvoren 1953., Muzej je ponovno zatvoren 1962. i konačno ponovno otvoren 1988.U novom postavu lijevo krilo posvećeno je brodovima, od kojih su neki materijali izloženi, poput rekonstrukcije krova s brončanim crijepom, dva sidra, obloge pramčanog kotača, nešto originalnih ili rekonstruiranih na brodu. oprema (a , klipna pumpa, blok, platforma s kugličnim ležajem). Vidljive su i dvije makete brodova u omjeru 1:5 te rekonstrukcija aposticcio krme prvog broda u punom mjerilu na kojoj su postavljene brončane kopije kutija s divljim protomima.Desno krilo je umjesto toga posvećeno stanovništvu albanskog teritorija u republikansko i carsko doba, s posebnim osvrtom na bogomolje; Izložena je zavjetna građa iz Velletrija (S. Clemente), iz Campoverdea (Latina) iz Genzana (Pantanaccijev stručak) i iz Dijanina svetišta u Nemiju, uz građu iz zbirke Ruspoli. Unutar ovog krila moguće je također vidjeti muzejski dio rimskog popločenja clivusa Virbii, koji je vodio od Ariccie do Dijanina svetišta.
