To jedyne w swoim rodzaju muzeum poświęcone jest liczącej 6.000 lat historii chleba jako niezbędnej podstawy ludzkiej kultury i cywilizacji. Swoje powstanie i rozwój zawdzięcza wieloletniemu osobistemu zaangażowaniu Willy'ego Eiselena (1896-1981) i jego syna Hermanna Eiselena (ur. 1926). Obaj zajmowali się produkcją i sprzedażą składników piekarniczych i należeli do czołowych dostawców dla branży piekarniczej.
Obaj przedsiębiorcy założyli w 1955 roku muzeum jako Niemieckie Muzeum Chleba w formie stowarzyszenia. Pierwsza stała ekspozycja pochodzi z 1960 roku. Było to pierwsze i przez wiele lat jedyne tego typu muzeum na świecie. Było ściśle prywatną instytucją finansowaną przez założycieli. W 1991 roku finansowanie muzeum przejęła Fundacja Eiselen, niezależna instytucja charytatywna; w tym samym czasie muzeum przeniosło się do Salzstadel, historycznego magazynu w centrum Ulm.
Tutaj muzeum rozkwitło i w 2004 roku powitało swojego milionowego gościa.
