Unikátní muzeum je věnováno šestitisícové historii chleba jako nepostradatelného základu lidské kultury a civilizace. Za svůj vznik a rozvoj vděčí desítky let trvajícímu osobnímu nasazení Willyho Eiselena (1896-1981) a jeho syna Hermanna Eiselena (nar. 1926). Oba se zabývali výrobou a prodejem pekařských přísad a patřili k předním dodavatelům pro pekařský průmysl.
Oba podnikatelé založili muzeum jako Německé muzeum chleba v roce 1955 jako spolek. První stálá expozice pochází z roku 1960. Bylo to první a dlouhá léta jediné muzeum svého druhu na světě. Jednalo se o přísně soukromou instituci financovanou zakladateli. V roce 1991 převzala financování muzea nezávislá charitativní instituce Eiselen Foundation; muzeum se zároveň přestěhovalo do Salzstadel, historického skladiště v centru Ulmu.
Zde muzeum vzkvétalo a v roce 2004 přivítalo miliontého návštěvníka.
