Geniş alanları Kyoto'nun ormanlık Higashiyama Dağları'nın eteklerinde yer alan Nanzenji Tapınağı, tüm Japonya'daki en önemli Zen tapınaklarından biridir. Bu, Japon Zen Budizminin Rinzai Mezhebi içindeki okullardan birinin ana tapınağıdır ve zaten büyük bir tapınak binası kompleksini daha da büyüten birkaç alt başlık içerir.
Nanzenji'nin tarihi, İmparator Kameyama'nın emeklilik villasını tapınağın şimdiki yerinde inşa ettiği ve daha sonra bir Zen tapınağına dönüştürdüğü 13.yüzyılın ortalarına kadar uzanmaktadır. Kuruluşundan sonra, Nanzenji istikrarlı bir şekilde büyüdü, ancak binaları geç Muromachi döneminin (1333-1573) iç savaşları sırasında tahrip edildi. Mevcut binaların en eskileri bu dönemden sonra inşa edilmiştir.