Napoli riiklik arheoloogiamuuseum on üks vanimaid ja tähtsamaid maailmas oma pärandi rikkuse ja ainulaadsuse ning panuse poolest Euroopa kultuuriloosse. Päritolu ja kujundab kogude on seotud joonis Charles III Bourbon, troonil Kuningriigi Napoli alates 1734, ja selle kultuuripoliitika: kuningas edendada uurimine vesuvian linnad matnud vulkaan 79 d.C. (alanud 1738 kell Herculaneum ja 1748 kell Pompei), ja jälgis ehitus-linna Muuseum, selle Asemel, kandes alates residences Roomas ja Parma ja on osa rikkaliku pärinud ema Elisabetta Farnese.
See on tingitud tema poeg Ferdinando IV plaan koondada praeguses hoones, mis on ehitatud lõpus 1500 sihtkohta cavallerizza ja 1616 kuni 1777 asukoht Ülikooli, kaks tuuma Farnese kollektsiooni ja kogumise Vesuuvi esemeid juba eksponeeritud Herculaneum muuseum sees Palace of Portici.
Alates 1777. aastast mõjutas hoonet pikk renoveerimis-ja laienemisprojektide etapp, mis oli usaldatud arhitektidele F. Fuga ja P. Schiantarelli. Prantsuse ülemvõimu kümnendil (1806-1815) tehti esimesed installatsioonid ja Bourbonide naasmisega Napolisse 1816.aastal võttis see endale tõelise Museo Borbonico nime. Universaalse muuseumina asus see instituudid ja laborid (Kuninglik Raamatukogu, Joonistusakadeemia, papüüri töökoda...), hiljem üle teistesse kohtadesse 1957.aastal.
1860. aastal rahvuslikuks saanud muuseumi kogusid on rikastatud leidude hankimisega Campania ja Lõuna-Itaalia paikades tehtud väljakaevamistel ning erakogudes. Pinacoteca üleandmine Capodimonte ' ile 1957.aastal määrab arheoloogiamuuseumi praeguse füsiognoomia. See maja vääris kogud ja arheoloogilised leiud eristada eelajaloolised ja hilja-Roman vanuses, millele on lisatud mitu ajalooliste kogude, sealhulgas Farnese pere, Borgia ja kogumise Vana-Egiptuse.
