Neapol Milliy Arxeologiya muzeyi merosning boyligi va noyobligi va Yevropa madaniy sahnasiga qo'shgan hissasi uchun dunyodagi eng qadimgi va eng muhimlaridan biridir. To'plamlarning kelib chiqishi va shakllanishi 1734-dan Neapol Qirolligining taxtida Bourbon Charlz III ning arbobi va uning madaniy siyosati bilan bog'liq: qirol 79 D.C. otilishidan tomonidan dafn vesuviy shaharlar razvedka targ'ib (Herculaneum da 1738 yilda boshlangan va 1748 yilda Pompeii da), va o'rniga bir muzeyga shahrida qurilish arra, Rimda Parma va boy qismi meros qolgan Parma.
Bu uning o'g'li Ferdinando IV cavallerizza maqsad bilan 1500 oxirida qurilgan joriy binoda, birga olib rejasi tufayli va 1616 1777 universiteti qo'ltiq qadar, Farnese yig'ish ikki yadrolari va Vesuvius asarlar yig'ish allaqachon Portici saroyida ichida Herculaneum muzeyida namoyish.
From 1777 qurilish ta'mirlash va kengaytirish loyihalari uzoq bosqichi ta'sir, me'morlar F. Fuga va P. Schiantarelli ishonib topshirilgan. Fransiya hukmronligining o'n yilligida (1806-1815) dastlabki o'rnatishlar qilindi va 1816-yilda boburiylarning Neapolga qaytishi bilan haqiqiy Museo Borboniko nomini oldi. Universal muzey sifatida yaratilgan institut va laboratoriyalar (Qirollik kutubxonasi, chizma Akademiyasi, papirus ustaxonasi...), keyinchalik boshqa joylarda o'tkazilishi 1957.
1860-yilda milliylashgan muzey kolleksiyalari Campania va Janubiy Italiya saytlaridagi qazishmalardan va xususiy kolleksiyadan topilmalar olish bilan boyitildi. 1957-yilda Pinakotekaning Kapodimontga ko'chirilishi Arxeologiya muzeyining hozirgi fiziognomiyasini belgilaydi. Bu qimmatbaho to'plamlarini uylar va arxeologik topilmalar bir necha tarixiy to'plamlarni qo'shiladi qaysi tarixdan ilgarigi va kech-Rim asrlar orasida ajralib, Farnese oila, shu jumladan,, Borgia va qadimgi Misr yig'ish.