Muziejus buvo pastatytas 1933-1939 m., kad jame tilptų du milžiniški laivai, priklausę imperatoriui Kaligulai (37-41 m. po Kr.), kurie buvo rasti ežero vandenyse 1929-1931 m. Todėl tai buvo pirmasis muziejus Italijoje, kuriame buvo pastatytas jo turinys - du korpusai, kurių matmenys atitinkamai 71,30 x 20 m ir 73 x 24 m, kurie, deja, buvo sunaikinti per 1944 m. kilusį gaisrą. 1953 m. vėl atidarytas muziejus buvo uždarytas 1962 m. ir galiausiai vėl atidarytas 1988 m.
Naujajame makete kairysis sparnas skirtas laivams, iš kurių eksponuojama kai kuri medžiaga, pavyzdžiui, rekonstruotas stogas su bronzinėmis čerpėmis, du inkarai, priekinio rato pamušalas, kai kurie originalūs arba rekonstruoti laivo įrenginiai (norija, stūmoklinis siurblys, blokas, platforma ant rutulinių guolių). Taip pat eksponuojami du 1:5 mastelio laivų maketai ir visiškai atkurta pirmojo laivo laivagalio apostilė, ant kurios pritvirtintos bronzinės dėžučių su ferinais kopijos.
Dešinysis sparnas skirtas Albanijos teritorijos apgyvendinimui respublikos ir imperijos laikais, ypatingą dėmesį skiriant kulto vietoms; čia eksponuojama votyvinė medžiaga iš Velletrio (S. Clemente), Kampoverdės (Latina), Genzano (Pantanacci stifa) ir Dianos šventovės Nemi, taip pat medžiaga iš Ruspolio kolekcijos. Šiame sparne taip pat galima pasigrožėti romėnų grindinio, kuriuo iš Arikijos buvo einama į Dianos šventyklą, fragmentu.
