Povijest Grotte di Nettuno seže u pretpovijesno doba. Nekoliko tragova, koji pripadaju neolitiku, pronađeni u njima, sugeriraju da je od njihovog nastanka prošlo oko 2.000.000 godina. Gotovo je sigurno da su ih primitivni ljudi poznavali i koristili prema svojim potrebama.Neptunove špilje nisu samo najpoznatije nego i najveće. Protežu se u dužini od oko 4 km, ali iz sigurnosnih razloga turisti mogu pristupiti samo jednom dijelu. Osim što predstavljaju važno turističko odredište i primaju posjetitelje iz cijeloga svijeta, Grotte di Nettuno su i odredište velike atrakcije za speleologe, koji jedini mogu posjetiti najskrovitije gudure.