A székesegyház padlómozaikja jelentős méretű, a főhajó teljes hosszában húzódik, és körülbelül 600 000 helyi mészkőből készült polikróm mozaikból áll. Az élet fáját ábrázolja, és Gionata püspök rendelte meg még 1163-ban, a kivitelezést pedig Pantaleone szerzetes végezte el az otrantói S. Nicola di Casale apátságból, aki 1165-ben fejezte be a remekművet.A mozaik első különlegessége, hogy a főbejárathoz igazodva a mozaikra rá van vésve a szerző neve, ami a korban legalábbis szokatlan, és valószínűleg annak a kiváltságnak köszönhető, hogy a művésznek köszönetképpen a mű nagyszerű sikeréért elismerést adhattak.Mint említettük, a legtöbb szakértő az ábrázolásnak az Életfát jelöli, de vannak ellentmondásos elméletek, és soha nem sikerült olyan következtetésre jutni, amely minden nézetet kielégítene, így a művet titokzatosság fátyla övezi.Az azonban világos, hogy a fa körül, amely a presbitérium bejáratától húzódik, az Ószövetség számos jelenete bontakozik ki, amelyek az ember által a bűnök leküzdéséhez és az örök üdvösség eléréséhez megtett gyötrelmes utat szimbolizálják: Ádám és Éva, Káin és Ábel eseményei, a pokol és a Paradicsom fogantatása. Nem hiányoznak a mitológiai és történelmi utalások sem, mint például Artúr király és Nagy Sándor. Szintén nagyon szembetűnő az év tizenkét hónapjának ábrázolása, amelynek egy kör alakú rész van szentelve, valamint a relatív évszakos munkák ábrázolása.A jelenlévő elemek és szimbólumok gazdagsága és változatossága újabb bizonyítéka annak, hogy Otranto mindig is találkozási pontot jelentett a kultúrák, népek és különböző művészeti és kulturális áramlatok között. A város által élvezett földrajzi helyzet megkönnyítette a Nyugat és Kelet közötti találkozást és cserét, gyakran kitéve a helyet a támadásoknak és invázióknak, amelyek inkább kedvezett, saját kultúrájukat erőltették. Az évezredes történelem után, ami megmaradt, az egy sor kincs, lenyomat, a különböző népek átvonulásának jelei, akik művészeti szempontból is és mindenekelőtt művészeti szempontból gazdagították Otranto kincseit.
