Podlahová mozaika katedrály je značně rozsáhlá, táhne se po celé délce hlavní lodi a skládá se z přibližně 600 000 polychromovaných teserů místního vápencového složení. Zobrazuje Strom života a byla objednána biskupem Gionatou již v roce 1163 a realizována mnichem Pantaleonem z opatství S. Nicola di Casale v Otrantu, který dílo dokončil v roce 1165.První zvláštností mozaiky je skutečnost, že je na ní vyryto jméno jejího autora, které koresponduje s hlavním vchodem, což je na tehdejší dobu přinejmenším neobvyklé a pravděpodobně to bylo způsobeno výsadou vzdát umělci hold jako poděkování za skvělý úspěch díla.Jak již bylo zmíněno, většina odborníků přisuzuje vyobrazení významu Stromu života, ale teorie jsou sporné a nikdy se nepodařilo dospět k závěru, který by uspokojil všechny názorové proudy, takže dílo zůstává zahaleno rouškou tajemství.Jisté však je, že kolem stromu, který se táhne od vchodu do presbytáře, se odehrává množství výjevů ze Starého zákona, které symbolizují strastiplnou cestu člověka k překonání hříchů a dosažení věčné spásy: události Adama a Evy, události Kaina, Ábela, početí pekla a ráje. Nechybí ani mytologické a historické odkazy, například na krále Artuše a Alexandra Velikého. Velmi nápadné je také vyobrazení dvanácti měsíců v roce, jimž je věnována kruhová část, stejně jako znázornění relativních sezónních prací.Bohatství a rozmanitost přítomných prvků a symbolů je dalším důkazem toho, že Otranto vždy představovalo místo setkávání kultur, národů a různých uměleckých a kulturních proudů. Geografická poloha, jíž se město těšilo, usnadňovala setkávání a výměnu mezi Západem a Východem, přičemž často vystavovala toto místo útokům a invazím, které mu více než přály, vnucovaly vlastní kulturu. Po tisícileté historii zůstala řada pokladů, otisků, známek průchodu různých národů, které obohatily otrantské poklady také a především z uměleckého hlediska.