V druhom poschodí Palazzo Zuckermann sa nachádza Múzeum Bottacin, v ktorom sa nachádza zbierka, hlavne numizmatická, ktorú daroval obchodník Terst Nicola Bottacin mestu Padova v roku 1865. Izby ideálne pripomínajú izby villa Trieste Del Bottacin. Sú tu obrazy, nábytok, staré zbrane, sochy.
Celá sekcia je venovaná viac ako 20 tisíc kusom zbierky mincí a medailí, triedených v chronologickom poradí, počnúc príkladmi pred rímskych čias, aby prešli na emisie-republikánske a cisárske mince, mince a stredoveké mince benátskej éry, ktorých zbierka teraz je jedným z najkompletnejších na svete.