În locul în care se spune că Sfântul Petru a fost răstignit este menționată deja în prima jumătate a secolului al IX-lea existența unei mănăstiri. În 1472 au fost restaurate clădirile complet dărăpănate, mănăstirea s-a extins și vechea biserică demolată. Proiectul noului este atribuit de unii lui Baccio Pontelli, de alții lui Meo del Caprino. În 1876 mănăstirea a fost cedată de statul Savoia Spaniei, căreia îi aparține încă, și din aceasta destinată sediului Academiei Regale a Spaniei din Roma. Biserica este înfrumusețată cu capodopere artistice din secolele XVI și XVII. Prima capelă din dreapta conține flagelarea și transfigurarea lui Sebastiano del Piombo; a doua are o frescă atribuită lui Pomarancio, unele fresce ale școlii lui Pinturicchio și o alegorică sibyl atribuită lui Baldassarre Peruzzi. Capela muntelui și cea anterioară conțin fresce de Giorgio Vasari. Altarul este atribuit lui Giulio Mazzoni, în timp ce monumentele funerare ale Cardinalului Del Monte și Roberto Nobili sunt de Bartolomeo Ammannati. În prima curte a mănăstirii se află așa-numitul templu al lui Bramante, care datează de la începutul secolului al XVI-lea și considerat de critici unul dintre cele mai semnificative exemple de arhitectură renascentistă. Este un mic monument de sărbătoare, înălțat și peripteros, dedicat martiriului Sfântului Petru. Templul are un corp cilindric excavat de nișe luminoase și înconjurat de o colonadă toscană.
