Etrüskçe adı bilinmemektedir, belki de Roma döneminde bir vilayet haline gelen ve Statonia olarak adlandırılan Statnes'ten (veya Staties) gelmektedir.Bunun yerine Pitigliano adı, birkaç bölgeye adını veren önemli bir Roma ailesi olan gens Petilia'dan geliyor gibi görünmektedir. Eski bir efsaneye göre, kasabanın kuruluşunun iki Romalıya bağlı olduğu söylenir: Petilio ve Celiano; isimlerinin birleşmesinden Pitigliano türetilmiştirÖte yandan Küçük Kudüs unvanı, yüzyıllar boyunca önemli bir Yahudi cemaatinin varlığından kaynaklanmıştır.Bölgedeki 'sığınma kentlerinin' tek varisi olan Pitigliano'da, yüzyıllar boyunca korunan elverişli koşullar, Yahudi ve Hıristiyan nüfus arasında istisnai bir arada yaşama ve hoşgörü ilişkilerinin gelişmesini mümkün kılmıştır, öyle ki kasaba 'Küçük Kudüs' olarak adlandırılmıştır. Hıristiyanlar ve Yahudiler arasındaki olağanüstü ilişki, 1799'da Getto'yu yağmalamak isteyen Fransız karşıtı askerlerin tacizlerine karşı halkın ve Hıristiyan çoğunluğun İsraillileri savunduğu tekil bir olayla kesin olarak pekişti.TarihM.Ö. 300-1000 yılları arasında bir Bronz Çağı köyü belgelenmiştir, ancak Pitigliano kayalığı, tüm Fiora nehri vadisi gibi, Neolitik (M.Ö. 6. binyıl) ve daha sonra Bakır Çağı'nda sıkça ziyaret edilmiştir.M.Ö. 8. yüzyılda, yakındaki Veio kenti nedeniyle Etrüsk yerleşimi, 6. yüzyılda zirveye ulaşmış, nekropol ve tapınak kalıntıları bulunan Fiora üzerindeki Poggio Buco'nun yerini almıştır; M.Ö. 500 civarında muhtemelen Chiusi kralı Porsenna tarafından yıkılmıştır.M.Ö. 1. yüzyıl - M.S. II. yüzyıl, ana yollar boyunca çiftlikler ve köylerle Roma varlığı, Pitigliano uçurumunun karşısındaki platoda çeşitli yapılarla gösterilmektedir.1061, Pitigliano toponimi ilk kez Nicholas II tarafından Sovana kanonlarına verilen bir boğada görülür.1188, başka bir belgede Pitigliano, 1000 yılından kısa bir süre sonra ait olduğu tüm Maremma'nın lordları olan Aldobrandeschi kontlarının mülkiyetindeki castro (müstahkem köy) olarak görünmektedir.1274 yılında Pitigliano, Orvieto Komünü ile yapılan savaşlarda Aldobrandeschi kontluğunun en önemli kalelerinden biri olarak ortaya çıkar.1313, Orsini'ler evlilik yoluyla Aldobrandeschi'lerin yerine Sovana Kontluğu'na geçtiler; önce Orvieto sonra Siena Komünleri ile uzun mücadelelere girmek zorunda kalan Orsini'ler, 1410'da Sovana da dahil olmak üzere neredeyse tüm Maremma'yı fethettikten sonra kontluğun başkentini Pitigliano'ya taşıdılar.1466'da küçük Pitigliano ilçesi, büyük İtalyan Devletlerinin hizmetinde bir servet kaptanı olan Niccolò III'ün iktidara gelmesiyle güç kazandı; onunla birlikte Pitigliano, Antonio da Sangallo, Baldassare Peruzzi ve Anton Maria Lari gibi sanatçıların üzerinde çalıştığı Rönesans anıtlarıyla zenginleşti.1604, Toskana Büyük Dükü I. Ferdinando, Orsini'nin tüm mülklerini satın alır: böylece Pitigliano ilçesi sona erer; yüzyılın ortalarından itibaren, burada güvenli bir sığınak bulan Yahudilerin sayısı artmaya başlar; 1643'te Medici, Papalık birliklerinin işgal girişimini engeller.1843 yılında Pitigliano, Piskoposluğun Sovana'dan devralınmasıyla ve Aydınlanma reformlarını takip eden ekonomik büyüme sayesinde şehir unvanını alır.