No se conoce el nombre etrusco, quizás de las Statnes (o Staties) que en época romana se convirtieron en prefectura y se llamaron Statonia. En cambio, el nombre de Pitigliano parece derivar de la gens Petilia, una importante familia romana que dio su nombre a varias localidades. Según una antigua leyenda, la fundación de la ciudad se debe a dos romanos: Petilio y Celiano; de la fusión de sus nombres derivó Pitigliano El apelativo de Pequeña Jerusalén, en cambio, tiene su origen en la presencia de una importante comunidad judía a lo largo de los siglos. En Pitigliano, única heredera de las "ciudades refugio" de la zona, las condiciones favorables conservadas durante siglos hicieron posible el desarrollo de unas relaciones excepcionales de convivencia y tolerancia entre la población judía y la cristiana, hasta el punto de que la ciudad fue designada "Pequeña Jerusalén". La extraordinaria relación entre cristianos y judíos se cimentó definitivamente con un singular episodio en 1799, cuando el pueblo y la mayoría cristiana defendieron a los israelitas de los abusos de los soldados antifranceses, que querían saquear el gueto.
Historia Entre el 300 y el 1000 a.C. se documenta un poblado de la Edad del Bronce, pero el acantilado de Pitigliano, como todo el valle del río Fiora, fue frecuentado ya en el Neolítico (6º milenio a.C.) y luego en la Edad del Cobre. En el siglo VIII a.C., el asentamiento etrusco, debido a la cercana ciudad de Veio, alcanzó su apogeo en el siglo VI, sustituyendo al cercano centro de Poggio Buco, en la Fiora, que albergaba necrópolis y restos de un templo; hacia el 500 a.C. fue probablemente destruido por Porsenna, rey de Chiusi. Siglo I a.C.-II d.C., la presencia romana, con granjas y aldeas a lo largo de las vías principales, está indicada por varias construcciones en la meseta frente al acantilado de Pitigliano. 1061, el topónimo Pitigliano aparece por primera vez en una bula emitida por Nicolás II a los canónigos de Sovana. En 1188, en otro documento, Pitigliano aparece como castro en posesión de los condes Aldobrandeschi, señores de toda la Maremma, a quienes pertenecía poco después del año 1000. En 1274, Pitigliano aparece como una de las principales fortalezas del condado de Aldobrandeschi en las guerras con el municipio de Orvieto. En 1313, los Orsini sucedieron a los Aldobrandeschi por matrimonio en el condado de Sovana; obligados a mantener largas luchas con los municipios primero de Orvieto y luego de Siena, tras la conquista por parte de estos últimos de casi toda la Maremma, incluida Sovana en 1410, los Orsini trasladaron la capital del condado a Pitigliano. En 1466, el pequeño condado de Pitigliano cobró fuerza con la llegada al poder de Niccolò III, un capitán de fortuna al servicio de los principales Estados italianos; con él Pitigliano se enriqueció con monumentos renacentistas, en los que trabajaron artistas como Antonio da Sangallo, Baldassare Peruzzi y Anton Maria Lari. 1604, Ferdinando I, Gran Duque de Toscana, compra todas las posesiones de los Orsini: así termina el condado de Pitigliano; a partir de mediados de siglo, comienza a crecer el número de judíos, que encuentran aquí un refugio seguro; en 1643, los Médicis frustran un intento de ocupación por parte de las tropas papales. En 1843, Pitigliano asumió el título de ciudad con la transferencia de la diócesis de Sovana y gracias al crecimiento económico que siguió a las reformas de la Ilustración.