Kraljevski mineraloški muzej smješten je u prestižnoj knjižnici Collegio Massimo dei Gesuititi. Osnovan u proljeće 1801. godine od strane Ferdinanda IV od Bourbona, bio je važno znanstveno-istraživačko središte s ciljem povećanja mineralnih resursa Napuljskog Kraljevstva. To ga razlikuje od mnogih drugih muzeja, stvorenih isključivo za očuvanje spektakularnog i uvijek fascinantnog svijeta minerala. Tamo su radili slavni mineralozi, uključujući Mattea Tondija i Arcangela Scacchija koji se i danas smatraju vodećim osobama u međunarodnom znanstvenom forumu. Najviši znanstveni ugled ustanova je dosegla 1845., godine kada je Muzej izabran za mjesto održavanja VII. kongresa talijanskih znanstvenika na kojem je sudjelovalo izvanredno tisuću šeststo jedanaest znanstvenika. Kraljevski mineraloški muzej također je odigrao važnu društveno-političku ulogu u povijesti grada. Godine 1848., nakon što je Ferdinand II dodijelio Ustav, prvi sastanci Zastupničkog doma održani su u monumentalnoj dvorani Kraljevskog muzeja; konačno je 1860. ugostio jedno od dvanaest biračkih mjesta za glasovanje o priključenju Kraljevini Italiji. Izložbeni prostor, površine oko 800 četvornih metara, sastoji se od monumentalne dvorane, te prostorija posvećenih Arcangelu Scacchiju i Antoniju Parascandolu. Visoka povijesna i znanstvena vrijednost zbirki svrstava Kraljevski muzej među najznačajnije talijanske mineraloške muzeje i svakako među najpoznatije u svijetu. 25 000 eksponata podijeljeno je u različite zbirke. Velika zbirka Kraljevskog muzeja sastoji se od minerala koji predstavljaju brojne geološke stvarnosti svijeta; neki su svojom ljepotom i veličinom prava rijetkost. Brojni primjerci, prikupljeni između 1789. i 1797., smatraju se 'povijesnim' i od posebnog su znanstvenog i kolekcionarskog interesa, budući da dolaze iz sada napuštenih europskih rudarskih nalazišta. Kolekcija Grandi Cristalli može se pohvaliti kristalima značajne veličine i savršenih oblika; među svim 482 kg par kristala hijalinog kvarca s Madagaskara, darovan Charlesu III od Bourbona 1740. i stavljen u Muzej početkom devetnaestog stoljeća. Vezuvska zbirka jedinstvena je u svojoj vrsti kako zbog svoje znanstvene važnosti tako i zbog rijetkosti i ljepote nekih nalaza. Započet ranih 1800-ih, s vremenom je obogaćen novim vrstama pronađenim tijekom posljednjih 200 godina na Vezuvu. Zbirka umjetnih kristala sastoji se od primjeraka koje je sintetizirao Arcangelo Scacchi i nagrađenih na Svjetskim izložbama u Londonu (1862.) i Parizu (1867.). Zbirka minerala Tufija Campanija, započeta 1807., predstavlja prave rijetkosti poput fluoroborita, koji odgovara diskreditiranom noceritu i hornezitu. Među nalazima iz Zbirke meteorita ističemo 7583 grama težak primjerak siderita, pronađen 1784. godine u Toluci u Meksiku. Naposljetku, prisjetimo se Zbirke tvrdog kamenja s kamejama tipičnim za napuljsko umijeće, Zbirke medalja iskovanih lavom Vezuva među kojima su one iz 1805. koje reproduciraju profile Ferdinanda IV. i Marije Karoline, te prekrasne medalje iskovane u lavi ističu se iz 1859. u čast Napoleona III., Zbirka znanstvenih instrumenata, uključujući kutomjer za refleksiju s okomitim krugom koji je Arcangelo Scacchi izradio 1851. godine, a izradio ga je napuljski majstor specijaliziran za pomorske alate.