A igreja teve uma história tumultuada. Em 512 DC Saint Germain, que mais tarde se tornaria bispo de Paris, convenceu o rei merovíngio Childebert a construir uma abadia com uma igreja. A igreja, que continha relíquias importantes, foi dedicada a São Vicente e à Santa Cruz. Foi uma das igrejas mais importantes da França e o local de descanso final dos reis merovíngios. Seu telhado era pintado de ouro, o que levou ao nome 'Saint-Germain-le-Doré' (Dourado Saint Germain). No século IX, A Igreja foi saqueada várias vezes pelos Vikings e, finalmente, destruída pelo fogo. Por volta do ano 1000, a reconstrução da igreja começou, e acabou sendo dedicada em 1163. Durante o final da Idade Média, vários edifícios adicionais foram erguidos no complexo da abadia beneditina, que se tornou um dos maiores e mais importantes de toda a França.
Durante a Revolução Francesa, As ordens religiosas foram suprimidas e a abadia foi usada como armazém. Uma grande explosão de pólvora armazenada no refeitório destruiu quase todo o complexo e danificou gravemente a Igreja.
A Igreja hoje A aparência atual da Igreja é o resultado de uma renovação no século XIX, quando o arquiteto Victor Baltard e o pintor Jean-Hippolyte Flandrin foram convidados a restaurar a Igreja ao seu antigo esplendor.
O exterior da Igreja é definido por sua torre sineira robusta, uma das mais antigas de toda a França. Mais duas torres construídas em ambos os lados do transepto não sobreviveram à era da revolução. O interior mostra uma mistura de diferentes estilos arquitetônicos, resultado da construção contínua ao longo dos séculos. Pilares originais do século VI sustentam o Coro do século XII; arcos românicos são combinados com abóbada gótica, e há até elementos barrocos. Existem vários túmulos interessantes nas capelas da Igreja, incluindo os do filósofo René Descartes e João II Casimir Vasa, que foi rei da Polônia no século XVII até se tornar o abade da Abadia de Saint-Germain-des-Prés.
Bairro Saint-Germain-des-Prés A Igreja deu seu nome a Quarter of Saint-Germain-des-Prés, uma área animada no sexto distrito que ganhou sua reputação como um distrito literário no século XX, quando escritores, intelectuais e filósofos se encontraram em um de seus muitos cafés. Filósofo Jean Paul Sartre e Simone De Beauvoir frequentemente se reuniam no 'Café De Flore' e Ernest Hemingway era um convidado frequente em 'Les Deux Magots'.
