Crkva i samostan San Damiano nalaze se u blizini centra Asiza. Kompleks je izvorno bio benediktinski samostan, čiji zapisi datiraju iz 1030.godine.
U crkvu stižete kroz kapelu: s desne strane naći ćete Madonu i dijete sa svecima Franjom, Clarom, Bernardinom i Jeromeom, fresku lokalnog umjetnika iz sredine četrnaestog stoljeća.
Crkva ima jednu lađu s živahnim bačvastim svodovima i dubokim zborom. Odmah desno od ulaza nalazi se prozor s kojeg je sveti Franjo bacio novac koji je svećenik San Damiano odbio za obnovu crkve. Duž zidova možete vidjeti ostatke žbuke obrubljene polikromnim okvirima pripremljenim za freske koje nikada nisu napravljene. U kapeli, koja je dodana 1535.godine, nalazi se drveno raspelo (izraz Kristova lica mijenja se ovisno o vidikovcu) koje je isklesao fra Innocenzo da Palermo 1637. Na glavnom oltaru nalazi se replika raspela koji je govorio svetom Franji (Izvornik se čuva u bazilici Santa Chiara). Drveni zborovi iz 1504.djelomično prekrivaju mali prozor kroz koji su komunicirali siromašni Klari i ispred kojeg je tijelo svetog Franje premješteno iz Porciunkole u Assisi.
Ulazeći u predvorje s desne strane, ispod kojeg su pokopana četiri suputnika Svete Klare, ulazite u sakristiju. S lijeve strane je jednostavan zbor u kojem ćete naći i propovjedaonicu Svete Klare. Na oltaru je raspelo, freska Pierrea Antonija Mezzastrisa iz 1482.godine. S lijeve strane možete vidjeti malu sobu u kojoj se, prema predaji, Franjo sklonio od oca.
Vraćajući se u predvorje, penjete se nekoliko stepenica, izlazeći desno kroz giardinetto di Santa Chiara (vrt Svete Clare), malu terasu s pogledom na ravnicu ispod.
Umjesto toga, dok se spuštate u samostan, možete se diviti na dva kutna zida freskama Eusebio da San Giorgio (1507.), prikazujući svetog Franje kako prima stigme i Navještenje. Zatim stižete do pravokutne blagovaonice s niskim stropovima, slične kripti, s izvornim klupama i stolovima: križ i vaza s cvijećem označavaju mjesto koje je nekada zauzimala Sveta Klara.
