San Francesco del Deserto er en lille og fredelig ø i lagunen i Venedig, beliggende mellem øen Burano og øen Sant'Erasmo.
San Francescos ø er hjemsted for et franciskanerkloster (Minor Friars) grundlagt i 1230. Den er omgivet af sandbanker og er omgivet af cypresser og fyrretræer.
Fordums tid hed øen San Francesco del Deserto Isola delle Due Vigne og var ejet af den venetianske adelsmand Jacopo Michiel.
Det siges, at San Francesco d'Assisi i 1220 opholdt sig der i tilbagetog i kort tid, og vendte tilbage fra østen og fra det femte korstog (ikke for at kæmpe, men for fredeligt at møde Malek-el-Kamel, Egyptens sultan).
På det tidspunkt var der på øen allerede en lille byzantinsk kirke, hvor St. Francis stoppede for at reflektere og bede sammen med broder Illuminato da Rieti, hans rejsekammerat.
I 1233 donerede Jacopo Michiel øen til Franciskanerordenen, og i dette øjeblik blev "Isola delle Due Vigne" omdøbt til "Isola di San Francesco".
På grund af sygdomme og plager som malaria, som spredte sig i disse sumpede områder, blev øen i '400 forladt for en kort periode: det var ved denne lejlighed, at suffikset "del Deserto" (af ørkenen) blev anvendt på hans navn, og omdøber den til øen San Francesco del Deserto.
Fra '400 og fremefter har San Francesco del Deserto altid været administreret af Franciskanerordenen, med undtagelse af det tidlige nittende århundrede (1808), hvor Napoleons tropper forvandlede øen til et pakhus og en tinderbox.
I 1858, gennem Padre Bernardino da Portogruaros arbejde, blev øen givet til bispedømmet Venedig, hvilket gjorde det muligt for munkene at genopbygge klostret, der selv er aktivt i dag.
Øen er kun tilgængelig med privat transport eller taxa, og du kan besøge den og blive der et par dage i tilbagetog efter at have fået aftale med munkene, der bor der.