San Francesco del Deserto je mali i miran otok u Venecijanskoj laguni, smješten između otoka Burano i otoka Sant'Erasmo.
Otok San Francesco dom je franjevačkog samostana (manja braća) osnovanog 1230. Okružen je pješčanim sprudovima, a po obodu je obavijen čempresima i borovima.
U antici se otok San Francesco del Deserto zvao Isola delle Due Vigne i bio je u vlasništvu venecijanskog plemića Jacopa Michiela.
Rečeno je da je 1220. San Francesco d'Assisi boravio ondje u povlačenju na kratko vrijeme, vraćajući se s Istoka i iz Petog križarskog rata (ne zbog borbe, već kako bi se mirno susreo s Malek-el-Kamelom, egipatskim sultanom).
U to je vrijeme na otoku već postojala mala bizantska crkvica u kojoj se sv. Franjo zaustavljao kako bi razmišljao i molio se s fratrom Iluminatom da Rietijem, svojim suputnikom.
Godine 1233. Jacopo Michiel darovao je otok franjevačkom redu i od tog trenutka "Isola delle Due Vigne" je preimenovana u "Isola di San Francesco".
Zbog bolesti i pošasti poput malarije, koje su se proširile ovim močvarnim područjima, '400. godine otok je nakratko napušten: tom je prilikom sufiks "del Deserto" (Pustinja) primijenjen na njegovu ime, preimenujući ga u otok San Francesco del Deserto.
Od '400. nadalje San Francesco del Deserto uvijek je bio pod upravom franjevačkog reda, s iznimkom ranog devetnaestog stoljeća (1808.) kada su Napoleonove trupe pretvorile otok u skladište i lomaču.
Godine 1858., djelovanjem Padre Bernardina da Portogruara, otok je predan Venecijanskoj biskupiji, što je omogućilo redovnicima da ponovno osnuju samostan, koji je i danas aktivan.
Otok je dostupan samo privatnim prijevozom ili taksijem i možete ga posjetiti i ostati tamo nekoliko dana u povlačenju nakon dogovora s redovnicima koji tamo žive.
