San Francesco del Deserto es una pequeña y tranquila isla de la Laguna de Venecia, situada entre la isla de Burano y la de Sant'Erasmo.
La isla de San Francesco alberga un monasterio franciscano (frailes menores) fundado en 1230. Está rodeada de bancos de arena y envuelta en su perímetro por cipreses y pinos.
Antiguamente la isla de San Francesco del Deserto, se llamaba Isola delle Due Vigne y era propiedad del noble veneciano Jacopo Michiel.
Se dice que en 1220 San Francisco de Asís se alojó allí en retiro durante un corto periodo de tiempo, al regresar de Oriente y de la Quinta Cruzada (no para luchar, sino para reunirse pacíficamente con Malek-el-Kamel, el sultán de Egipto).
Por aquel entonces, en la isla ya había una pequeña iglesia bizantina donde San Francisco se detenía a reflexionar y rezar con Fray Illuminato da Rieti, su compañero de viaje.
En 1233, Jacopo Michiel donó la isla a la Orden Franciscana y desde ese momento la "Isola delle Due Vigne" pasó a llamarse "Isola di San Francesco".
A causa de las enfermedades y plagas, como la malaria, que se propagaban en estas zonas pantanosas, en el año 400 la isla fue abandonada durante un breve periodo: fue en esta ocasión cuando se aplicó el sufijo "del Deserto" a su nombre, rebautizándola en Isla de San Francesco del Deserto.
Desde el '400 en adelante, San Francesco del Deserto siempre ha sido administrado por la Orden de los Franciscanos, con la excepción de principios del siglo XIX (1808), cuando las tropas de Napoleón transformaron la isla en un almacén y un polvorín.
En 1858, por obra del padre Bernardino da Portogruaro, la isla fue cedida a la diócesis de Venecia, lo que permitió a los monjes refundar el monasterio, aún hoy activo.
A la isla sólo se puede acceder en transporte privado o en taxi y se puede visitar y permanecer allí unos días de retiro tras ponerse de acuerdo con los monjes que la habitan.
