Iš San Matteo bažnyčios, kurią Doria pastatė kaip savo kilnią koplyčią, atsiveria vaizdas į mažą Piazza San Matteo Genujoje.XVI a. renovacijos metu interjeras su trimis navomis beveik visiškai prarado savo originalų gotikinį pobūdį,iš kurio liko tik keturios ogivalio arkos prie kupolo pagrindo, palaikomos dviem stulpais presbiterijos link ir dviem stulpeliais link navų. Centrinė Nava yra atskirta nuo šoninių stulpelių. Choras, altorius su trofėjais, du pulpitai ir presbiterijos urnos priskiriami Silvio Cosini ir Giovanni Angelo Montorsoli. Visos šiuo metu esančios dekoracijos priskiriamos XVI a. renovacijai. Navos skliaute yra Etiopijos Drakono stebuklas Luca Cambiaso ir San Matteo pašaukimas Giovanni Battista Castello. Ant altoriaus į dešinę nuo majoro dedamas Šventosios šeimos paveikslas su Bernardo Castello Šv. Ona, nuo XVI a.; kairėje-Kristus tarp šventųjų ir donorų Andrea Semino. Presbiterijos sienose yra šventųjų Pelagijaus ir Maksimo marmurinės arkos, Novigrado globėjai, Istrijoje, kurių relikvijas į Genują 1381 m.nugabeno Gaspare Spinola. Po aukštu altoriumi yra išsaugotas kardas, priklausantis "Tėvynės tėvui" Andrea Doria, kurį jam pagal tradiciją suteikė Popiežius Paulius III. Nišoje navoje yra Jėzaus nusodinimas kape, polichrominė medinė Antono Marijos Maragliano skulptūra, o apse nišose esančios statulos (gailestingumas, įkvėptas Mikelandželo, Dovydo, Jeremijo, Jono Krikštytojo ir Šv.
