Aslında katedralin tarihi 1000 yılının ikinci yarısına kadar uzanmaktadır ve Messapian, Roma ve erken Hıristiyan köylerinin antik kalıntıları üzerine inşa edilmiştir. Ayrıca çok sayıda saldırıya uğramış ve birkaç kez yıkılıp yeniden inşa edilmiştir. Hepsinden önemlisi, şehir için en üzücü sayfalardan birinin yazıldığı 1480 Türk istilasıdır: katedralin içinde, aslında, saldırıdan kaçmak için bu duvarlara sığınan inananlar ve din adamları katledilmiştir. Kilise ve tüm şehir Aragonlular tarafından kurtarılıncaya kadar, Hıristiyanlara ait bu alan yağmalanarak camiye dönüştürüldü ve içerdiği sanatsal hazineler yok edildi.Bu nedenlerden dolayı, Katedral özgün bir tarza sahiptir: ön cephe, 16 yakınsak ışın tarafından çaprazlanan ince Gotik tracery ile zenginleştirilmiş büyük bir merkezi gül penceresi ile üçgen bir forma sahiptir; arşitravı destekleyen iki sütun tarafından eşlik edilen Barok tarzında büyük bir portal ve daha sonra eklenen ve sol tarafta bulunan daha düşük bir portal olmak üzere iki portal vardır. Bunlar, yıllar boyunca Otranto piskoposluğunun başına geçen çeşitli başpiskoposlar tarafından yaptırılan unsurlardır.Yapı bir bazilika planına sahiptir ve iç mekanı mimari ve sanatsal bir gösteridir. Geniş çift lunat kemerlerle birbirine bağlanan beş Korint sütun sırası ile sınırlandırılmış üç nefe bölünmüş klasik bölüm hemen göze çarpmaktadır. Nef ve şanseli süsleyen, yaldızlı detaylara sahip güzel ahşap laküner tavandır. Orta koridorları zenginleştiren resimler ve kutsal ayinlere ve Hıristiyan sembollerine adanmış altı sunak vardır.Sağ koridorun sonunda Katedral'in en dokunaklı anılarından biri yer almaktadır: Şehitler Şapeli. Kilisenin bu bölümü, inançlarından vazgeçmek istemedikleri için 1480 yılında Türkler tarafından katledilen 800 Hıristiyan sakini olan Otranto Şehitleri'nin tarihi imhasının anısına adanmıştır. Sergilenen kalıntılara, kemiklere ve muhtemelen cinayetlerin işlendiği 'şehitlik taşına' bakmak insanı kesinlikle nefessiz bırakıyor ve bizi din savaşlarının bugün hala neden olduğu acıya geri götürüyor.Katedralin iç mekanının gerçek mücevheri zemin mozaiğidir: mutlak değere, şaşırtıcı güzelliğe ve büyük öneme sahip bir sanat eseri. Keşiş Pantaleone tarafından yaratılan ve 1164 yılında tamamlanan bu şaheser, aslında hayat ağacını ve Eski Ahit'te anlatılan, insanın günahtan dönmek ve ebedi kurtuluşu aramak için izlediği yolu anlatan bölümleri tasvir etmektedir. Bu nedenle mozaiğin 'aktörleri' Adem ve Havva'nın yanı sıra, elbette her biri kendi sembolik yükünü taşıyan diğer karakterler ve çok sayıda hayvandır. Eser, nef ve şanseli kendi ihtişamıyla süslemektedir.Bununla birlikte, 11. yüzyılda inşa edilen ve tüm yapının mimari açıdan en ilginç bölümlerinden biri olan mahzen çok daha eskidir. Aslında Apulian mahzenlerinin en eskisidir ve önemi de hatırı sayılır büyüklüğünden kaynaklanmaktadır. Beş nefe ve 72 sütun ve sütuna bölünmüş olan mahzenin özel yapısı, Cordova'daki Mesquita ve Konstantinopolis'teki Sultanahmet Camii'nin bir tür minyatürü olduğu sonucuna varılmasına yol açmaktadır ki bu da Otranto'nun her zaman kahramanı olduğu kültürel karışımın bir başka kanıtıdır. Kültürel bir karışım, halkların buluşması, farklı sanatsal üslupların bir araya gelmesi, yeraltı şapelinde bir başka önemli unsur tarafından tanıklık edilmektedir: üzerine inşa edildiği 42 sütunun inanılmaz çeşitliliği ve heterojenliği. Aslında bunların her birinin kendine özgü mermer ve granit kalitesi ve kökeni ile İyon, Korint, Bizans ve İslam tarzlarında farklı başlıkları vardır. Ayrıca, mahzene katedralin içinde bulunan iki merdiven aracılığıyla erişilebilmektedir.