Na cijelom području na kojem se trenutno nalazi bazilika Santa Maria sopra Minerva i susjedni samostan, nalazila su se tri hrama starog Rima: Minervium, domicijanskog podrijetla podignut u čast Minerve Calcidica, Isèum posvećen Izidi i Serapèum posvećen Serapisu.Upravo na ruševinama drevnog Fanum Minervae (koji je Gneo Pompeo posvetio Minervi Chalcidici, čiji se kip danas nalazi u Vatikanu), mali oratorij posvećen Djevici sagrađen je u osmom stoljeću, odmah nazvan Minervum, koji je darovao papa Zaharija redovnicama bazilijankama pobjegla iz Carigrada zbog progona ikonoklasta.Vrlo je vjerojatno da se ta primitivna kultna građevina nalazila u korespondenciji s lijevim krakom transepta onoga što će pet stoljeća kasnije biti velika dominikanska crkva.Godine 1280., kako svjedoči pismo pape Nikole III. od 24. lipnja upućeno senatorima Giovanni Colonni i Pandolfu Savelliju, započela je gradnja grandiozne gotičke crkve s tri lađe, vjerojatno prema nacrtu dominikanaca fra' Sisto Fiorentino i fra' Ristoro da Campi (isti oni koji su izgradili Santa Maria Novella u Firenci). Sljedećih godina projekt je promicao i papa Bonifacije VIII., koji je 1295. darovao pozamašnu svotu novca, a pratili su ga i brojni vjernici svojim ostavštinama.U drugoj polovici 16. stoljeća počinje velika ekspanzija i preobrazba čitavog minervijskog kompleksa koji je do tada postao sjedištem visokih hijerarhija reda.Godine 1600., nakon obnove poprečnih kapela, izgradnje ili rekonstrukcije bočnih, svođenja lukova lađa na okrugle lukove drvenim i štukaturnim nadgradnjama, crkva je poprimila pretežno barokni izgled, a mnoge su bile plemićke obitelji koje su promicale obnovu njegovih kapela, naručivši djela od Berninija, Baciccije, Rainaldija i drugih važnih predstavnika rimskog baroka.Treba podsjetiti da će 11. srpnja 1667. godine na trgu ispred njega biti postavljen spomenik malom slonu, kojeg je dizajnirao Bernini, a izradio Ercole Ferrata, koji je odmah postao karakterističnim simbolom Piazze della Minerva i po sada sastavni dio cjelokupne vizure crkve.Kao što je već spomenuto, u osamnaestom stoljeću, voljom Benedikta XIII. i projektima arhitekata Raguzzinija i Marchionnija, izvršena je dekoracija pročelja i time je naglašen barokni karakter cijele građevine.Godine 1808., s napoleonskom okupacijom grada i potiskivanjem vjerskih korporacija, u samostanu je bilo smješteno preko dvije tisuće vojnika, pa kada su dominikanci 1814. ponovno došli u posjed svojeg sjedišta, morali su započeti niz radova na sanaciji štete. izazvale trupe iu tom je ozračju sazrijevala ideja o potpunoj obnovi crkve.Počevši od 2. siječnja 1824., dominikanski arhitekt Fra' Girolamo Bianchedi vratio je zgradu bitnijim linijama, eliminirajući barokne skele s bočnih lukova i premještajući mnoge nadgrobne spomenike koji su je tiskali iz velike središnje lađe na bočne; hram je ponovno otvoren za bogoslužje 3. kolovoza 1855., za proslavu blagdana patrijarha San Domenica.Unatoč mučnim povijesnim događajima, od kojih zgrada još uvijek nosi vidljive znakove, bazilika je jedini primjer srednjovjekovne gotičke crkve u gradu Rimu.Santa Maria sopra Minerva sadrži mnoga umjetnička djela. Grobnica svete Katarine Sijenske je prekrasna, majstorski restaurirana u jubilarnoj 2000. godini kada je skulptura oslobođena uljanih boja koje su je preobrazile u voštani kip u devetnaestom stoljeću i obnovila bijeli mramor iz petnaestog stoljeća, od najslavniji od svih dominikanskih umjetnika, slikar Fra Giovanni da Fiesole, poznat kao Beato Angelico,U crkvi su sačuvana mnoga umjetnička djela: "Uskrsli Krist" Michelangela, iz 1519.-1520.; kapela Carafa, remek-djelo Filippina Lippija, koji je raskošio najbolje u freskama na zidovima i na veličanstvenoj ploči na oltaru svoje velike umjetnosti;Iza sakristije nalazi se sugestivna "Stanza di S. Caterina", obnovljena 1637. s istim zidovima sobe u kojoj je umrla u ulici di S. Chiara, s vrlo oštećenim freskama iz škole Antoniazza Romana. Značajna je kapela Carafa koju je između 1489. i 1492. sagradio i lijepo uredio napuljski kardinal Oliviero Carafa u čast sv. Tome Akvinskog.Na unutarnjim zidovima nalazi se prekrasan ciklus fresaka Filippina Lippija koji se, nedavno restauriran, smatra jednim od najbogatijih slikovnih kompleksa kasnog petnaestog stoljeća u Rimu.
Top of the World