Kościół Santa Maria di Rivotorto stoi kilka kilometrów od Santa Maria degli Angeli i został zbudowany w stylu neogotyckim po trzęsieniu ziemi w 1854 roku, na miejscu poprzedniego budynku zbudowanego w celu ochrony "TUGURIO francescano", który jest obecnie przechowywany wewnątrz kościoła. To ruiny miejsca, w którym według tradycji święty i jego towarzysze schronili się, aby się modlić i medytować. Na fasadzie kościoła znajdują się herby Bazyliki św. Franciszka (od której zależało sanktuarium), a nad głównymi drzwiami napis: "Hic primordia Fratrum Minorum" (tu początki Braci Mniejszych), który przypomina tradycję, według której Święty Franciszek wypracował fundamenty reguły Franciszkańskiej.
Wnętrze kościoła ma trzy nawy, oddzielone wielobocznymi kolumnami. Tutaj znajdziesz skromne "TUGURIO di somma umilitate", w miejscu, w którym został odkryty, miejsce, w którym Święty schronił się wraz z Bernardo da Quintavalle i Pietro di Catanio. Składa się z trzech niewielkich pomieszczeń, z których druga służy jako kaplica, z XV-wiecznym ołtarzem komunijnym na ośmiobocznym cippusie. W kościele, na przeciw-fasadzie, znajduje się obraz św. Michała Archanioła autorstwa Domenico Mattei. Na ścianach znajdują się obrazy Cesare Sermei nawiązujące do historii Franciszkanów.
