Vesuvobservatoriet blev bygget to kilometer fra Vesuvkrateret i en tid med stor begejstring for videnskab i almindelighed og for studier af jordmagnetisme i særdeleshed. Observatoriets historie fra dengang til i dag har vekslet mellem øjeblikke med stor glans og perioder med nedgang.Efter fem århundreders stilhed bragte det ødelæggende udbrud i 1631 Vesuv til en næsten uafbrudt aktivitet, hvilket førte til et krav om løbende overvågning af fænomenerne for at kunne forudsige deres adfærd, et krav, som endog blev støttet af kong Karl af Bourbon i slutningen af det 17. århundrede. I 1767 gennemførte Giovanni Maria della Torre omhyggelige undersøgelser af den magnetiske deklination, og i første halvdel af det 19. århundrede var Vesuv det mest analyserede vulkanske sted i verden og tiltrak videnskabsfolk fra hele verden, herunder Charles Babbage, der var interesseret i at verificere sine teorier om varmeledning.De videnskabelige akademier bad i begyndelsen af det 19. århundrede de forskellige regeringer om at opføre et center, hvor de kunne bo, og Ferdinand II af Bourbon, bistået af minister Nicola Santangelo, imødekom anmodningen, idet begge var tilhængere af udviklingen af videnskab og teknologi (opførelsen af Italiens første jernbane var tilstrækkelig). Fysikeren Macedonio Melloni fik til opgave at grundlægge det meteorologiske observatorium i 1839. Det var sidstnævnte, der købte det magnetiske og meteorologiske udstyr til det valgte sted, Collina del Salvatore (Frelserbjerget), som opfyldte de tre krav, som Melloni stillede: "fri horisont, nærhed til skyerne, afstand til de omkringliggende lande".Den 16. marts 1848 blev observatoriet endelig overdraget til Melloni, som dog på grund af sine liberale idéer blev afskediget fra sin stilling efter opstandene i '48. Geofysikeren Luigi Palmieris interesse for observatoriet gav det nyt liv, og det blev afsluttet i 1856 med opførelsen af et meteorologisk tårn. Palmieri byggede den første elektromagnetiske seismograf i historien, hvormed han verificerede overensstemmelsen mellem vulkanske og seismiske processer. I 1862 udarbejdede Palmieri et forskningsprogram bestående af et netværk af stationer til måling af forskellige parametre, der var nyttige for at foregribe vulkansk aktivitet; fra det øjeblik var en moderne undersøgelsesmetode født. Der manglede ikke dramatik for observatoriet og dets gæster, da det i 1872 blev omringet af en bølge af lava og var isoleret i nogle få dage.Palmieris efterfølger i spidsen for centret blev geologen Raffaele Matteucci, som fyldte avisernes forsider på grund af en bitter kontrovers med Matilde Serao, der var resultatet af en misforståelse om Matteuccis virkelige hensigter under endnu et udbrud, og ledelsen af centret, der var i en betydelig forfaldstilstand, blev overtaget af Giuseppe Mercalli, som forsøgte at genoplive dets tilstand, men hans tragiske død afbrød hans arbejde. Under krigen rekvirerede de allierede centret; fra 1983, på højdepunktet af den flegræiske bradyseisme, blev det operationelle hovedkvarter flyttet til en offentlig bygning i Napoli på Posillipo-højen. I dag ligger hovedkvarteret for operationel forskning og overvågning i Napoli, Via Diocleziano 328, mens det historiske sted på Vesuv rummer et vulkansk museum, hvor man bl.a. kan beundre de gamle meteorologiske og geofysiske instrumenter, der er designet af de berømte videnskabsmænd, som arbejdede der i over 150 år.