Η αίθουσα, που ονομάζεται Θέατρο για το χαρακτηριστικό Αμφιθεατρικό σχήμα της, σχεδιάστηκε το 1637 για ανατομικά μαθήματα από τον αρχιτέκτονα Antonio Paolucci που ονομάζεται Il Levanti, μαθητής Carracci. Ήταν καλυμμένη με ξύλο πεύκου και διακοσμημένο με δύο σειρές από αγάλματα που απεικονίζουν σε χαμηλή δώδεκα διάσημοι ιατροί (Ιπποκράτης, ο Γαληνός, ο Φαμπρίτσιο Bartoletti, Τζιρόλαμο Sbaraglia, Marcello Malpighi και Carlo Γκρεμίστηκε, Mondino de' Liuzzi, Bartolomeo da Varignana, Πέτρου Argelata, Costanzo Varolio, ο Ιούλιος Καίσαρας Aranzio, Gaspare Tagliacozzi) και στην κορυφή είκοσι από τις πιο διάσημες ανατόμους της μπολονέζ Μελέτη. Η καρέκλα του αναγνώστη, η οποία έχει θέα εκείνη του διαδηλωτή, πλαισιώνεται από δύο αγάλματα που ονομάζονται "ξεφλουδισμένα", γλυπτά το 1734 σε ένα σχέδιο του Ercole Lelli, τα οποία χρησιμοποιήθηκαν για να απεικονίσουν το ανθρώπινο σώμα, σαν ένα ανοιχτό βιβλίο. Πάνω από το θόλο μια καθισμένη γυναικεία φιγούρα, αλληγορία της ανατομίας, λαμβάνει ως φόρο τιμής από ένα φτερωτό στόκοδεν είναι ένα λουλούδι, αλλά ένα μηριαίο οστό. Το ανατομικό δωμάτιο υπέστη σοβαρές ζημιές στον βομβαρδισμό που στις 29 Ιανουαρίου 1944 κατέστρεψε αυτή την πτέρυγα του κτιρίου και ξαναχτίστηκε στην άμεση μεταπολεμική επαναχρησιμοποίηση των αρχικών ξύλινων γλυπτών, ευτυχώς ανακτήθηκε από τα ερείπια. Είναι ένα από τα παλαιότερα διατηρημένα ανατομικά θέατρα.
