З моманту адкрыцця ў 2001 годзе кардынал Карла Марыя марціні, у якім ён быў тады пад назвай у 2017 годзе, Музей з'яўляецца кропкай прыбыцця важнага праекта, у якім даў свой вырашальны ўклад у некаторыя з найбуйнейшых фігуркі арцыбіскупаў міланскіх хх стагоддзя. Яго паходжанне ўзыходзіць да першага разумення Блажэннага Ільдэфонса Шустэра 1931 года, а затым адноўлена кардыналам Монтини ў 1960 годзе, які паказвае ў якасці месца новага музея манастыры Святога Еўстаргія, аднаго з ключавых месцаў для гісторыі хрысціянства Амбразіяна. Будзе, нарэшце, кардынала марціні, у васьмідзесятыя гады, цяжкая задача, каб даць пачатак работ па рэканструкцыі манастыра, які быў моцна пашкоджаны ў выніку бамбаванняў Другой сусветнай вайны, ускладзеных на вывучэнне Belgiojoso.Тут размяшчаўся, пачынаючы з двухсот, першы дамініканскі Міланскі манастыр і два манастыры, дзе знаходзяцца Музей базылікі Святога Еўстаргія і епархіяльны музей, таму тое, што засталося ад гэтага старажытнага манастыра.
Пастаянная калекцыя епархіяльнага музея, якая займае другую мясціна, складаецца з больш чым тысячы работ паміж II і XXI стагоддзямі. З арцыбіскупскай плошчы прыйшлі калекцыі міланскіх арцыбіскупаў (частка калекцыі Монці, Вісконці, Рыкардзі, Поццабанелі і поўная калекцыя Эрба Адэскальчы).
Акрамя карцін з цэркваў епархіі, у музеі захоўваецца значная група твораў богаслужбовай мэблі. Завяршаюць калекцыю секцыя, прысвечаная залатым фондам (у асноўным тасканскія працы XIV і XV стагоддзяў, сабраныя прафесарам Альберта Креспи і падораныя музею), а таксама скульптуры і карціны з калекцыі Кацярыны Марсенаро, малюнкі з калекцыі Sozzani і каштоўную спадчыну Шуберта.
Нарэшце, да першага ядра скульптурных работ Луцыя фантана былі дададзеныя шматлікія працы XX і XXI стагоддзяў, што сведчыць аб росце цікавасці музея да сучаснасці.
