Мозаїка на підлозі собору має значні розміри, простягаючись на всю довжину головної нави, і складається з приблизно 600 000 поліхромних тессерів з місцевого вапняку. Вона зображує Дерево Життя і була створена на замовлення єпископа Джоната ще в 1163 році, а виконав її монах Панталеоне з абатства Сан Нікола ді Казале в Отранто, який завершив шедевр у 1165 році.Першою особливістю мозаїки є те, що на ній викарбувано ім'я її автора, відповідно до головного входу, що є щонайменше незвичним для того часу і, ймовірно, пов'язано з привілеєм віддати належне художнику як подяку за блискучий успіх твору.Як уже згадувалося, більшість експертів надають цьому зображенню значення Дерева життя, але існують суперечливі теорії, і жодного висновку, який би задовольняв усі наукові школи, так і не було зроблено, що залишає завісу таємничості навколо твору.Зрозуміло, однак, що навколо дерева, яке тягнеться від входу до пресвітерії, розгортається безліч сцен зі Старого Завіту, які символізують звивистий шлях, пройдений людиною для подолання гріхів і досягнення вічного спасіння: події Адама і Єви, Каїна, Авеля, зачаття Пекла і Раю. Не бракує міфологічних та історичних посилань, наприклад, на короля Артура та Олександра Македонського. Також дуже вражає зображення дванадцяти місяців року, яким присвячена кругла частина, а також зображення відповідних сезонних робіт.Багатство і різноманітність присутніх елементів і символів є ще одним доказом того, що Отранто завжди був місцем зустрічі культур, народів і різних мистецьких і культурних течій. Географічне положення міста сприяло зустрічам і обміну між Заходом і Сходом, часто піддаючи це місце нападам і вторгненням, які не тільки сприяли, але й нав'язували власну культуру. Після тисячоліть історії залишилася низка скарбів, відбитків, знаків проходження різних народів, які збагатили скарби Отранто також і, перш за все, з мистецької точки зору.
