Унікальний музей присвячений 6 000-річній історії хліба як незамінної основи людської культури та цивілізації. Своїм створенням та розвитком він завдячує багаторічній особистій відданості Віллі Айзелена (1896-1981 рр.) та його сина Германа Айзелена (1926 р.н.). Обидва займалися виробництвом і продажем інгредієнтів для хлібобулочних виробів і були одними з провідних постачальників для хлібопекарської торгівлі.
У 1955 році ці два підприємці заснували музей як Німецький музей хліба як об'єднання. Перша постійна виставка датується 1960 роком. Це був перший і протягом багатьох років єдиний музей такого роду у світі. Це була суто приватна установа, що фінансувалася засновниками. У 1991 році фінансування музею перейшло до незалежної благодійної організації "Фонд Айзелен", і тоді ж музей переїхав до Зальцштаделю, історичного сховища в центрі Ульма.
Тут музей розквітнув і у 2004 році прийняв свого мільйонного відвідувача.