אוניברסיטת קוימברה (באנגלית: University of Coimbra Botanical Gardens) ממוקמת במרכז ההיסטורי של העיר, על אחד המדרונות של הגדה הימנית של נהר מונדגו. זהו הגן הבוטני הגדול ביותר בפורטוגל ומתוארך ל-1773.; תחילת העבודה הייתה תחת ניהולו של דומינגוס ונדלי (domingos Vandelli) (1735-1816), שהגיש הצעה לתוכנית דומה מאוד לגינת פאדואה. עם זאת, רק חלק אחד מהפרויקט שלו נבנה, המרפסת שנקראה "הכיכר", על המדרון של מנזר הבנדיקטינים.מסלולי הנוף, ערוצי פרחים, צמחים ועצים מענגים לחקור, וזה באמת אחד הגנים המושכים ביותר באירופה. ביתם של למעלה מ-1200 מינים שונים של צמחים ועצים, ניתן למצוא אקליפטוס שגדל ליד עצי במבוק ואלמוגים, בין היתר.
