בזיליקת סן קלמנטה אל לטראנו שאינה מתויירת זו מספרת את ההיסטוריה של רומא בהתבסס על השכבות השונות של הכנסייה. הכנסייה הנוכחית "סן קלמנטה", המוקדשת לאפיפיור קלמנט הראשון, נבנתה על גבי כנסייה מהמאה ה-4 במהלך המאה ה-12. מתחת לזה נמצאו עוד הרבה יסודות רומאים.הבזיליקה הנוכחית היא אחת מני רבות ברומא ואינה הסיבה העיקרית לביקורכם, אך שרידים של בתים רומיים (500-27 לפנה"ס) נמצאו 20 מטרים מתחת לכנסייה זו. משערים שהבתים נהרסו בשריפה גדולה בתקופת שלטונו של הקיסר נירון ומאוחר יותר שימשו כסודות.על יסודות אלו נמצא בית גדול נוסף שנבנה במאה ה-1. בית זה שימש ככנסייה סודית לאפיפיור קלמנס באותה תקופה, מכיוון שלא היה עדיין חופש דת.במהלך המאה ה-4, כאשר ניתן חופש הדת, נבנתה בזיליקה על גבי הכנסייה הסודית. הכנסייה הוקדשה לקברו של קלמנט הקדוש, יורשו השלישי של פטרוס כאפיפיור. מה שמייחד את הבזיליקה הזו הוא עד כמה היא עוטרה בעושר על ידי ציירים ופסלים.ב-1084, חלק גדול מהכנסייה נהרס בפשיטות ויקינגיות, ולאחר מכן הקים האפיפיור פסחאל כנסייה חדשה על גבי הישנה במאה ה-12. על מנת ליצור בסיס חזק, חלקים מהכנסייה הישנה נלבנו ומילאו.מאז 1862 בוצעו חפירות רבות כדי לחשוף מבנים עתיקים, פסיפסים וציורי קיר של הכנסייה התחתונה. כאשר אתה מבקר בכנסייה, אתה מטייל בין הרבדים השונים של ההיסטוריה שלה.