ההיסטוריה של כנסיית סנטה מריה לה נובה קשורה לתנועות הקונבנציונאליות הראשונות. הקהילה הפרנציסקאנית הראשונה בנאפולי (1216) התיישבה על חורבות וילה רומית, והקימה את סנטה מריה עד פלטיום במקום בו תקום מאוחר יותר קסטל נואובו. כאשר קאריו הראשון מאנז'ו החרים את השטח ונתן לפרנציסקנים אדמה נוספת שעליה ניתן לבנות את המנזר החדש, נבנה האתר הנוכחי וקיבל את שמה של סנטה מריה לה נובה (1279).המראה הנוכחי של הבניין הוא זה של המאה ה-16, לאחר שנבנה מחדש על ידי ג'ובאני קולה די פרנקו (1596-1599). הפנים, שהועשר בתקופות שונות, נשלט על ידי התקרה, דוגמה נוספת, אחרי סן גרגוריו ארמנו, של נגרות עץ מגולפת ומוזהבת, שבה משובצים ארבעים ושישה לוחות, שצוירו מ-1598 עד 1603. נראה גם מהחזית. היא הקפלה של סן ג'אקומו דלה מארקה, בציור פרסקו על ידי מאסימו סטנציונה עם סצנות מחייו של הקדוש (1644-1646 לערך).למנזר יש בית אוכל ושני קלויסטרים, הקטן שבהם מצויר בפרסקו במחצית הראשונה של המאה ה-17 עם מוטיבים גרוטסקיים וסצנות מחיי סן ג'אקומו דלה מרקה.
