האולם, שנקרא התיאטרון לצורת האמפיתיאטרון האופיינית לו, תוכנן בשנת 1637 לשיעורים אנטומיים על ידי האדריכל בולונז אנטוניו Paolucci בשם Il Levanti, תלמיד בית ספר קראצ ' י. הוא היה מכוסה בעץ אורן ומעוטר בשתי שורות של פסלים המתארים ב -12 רופאים מפורסמים נמוכים (Hippocrates, Galen, Fabrizio Bartoletti, Girolamo Sbaraglia, Marcello Malpighi ו-Carlo Shattered, Mondino de' Liuzzi, Bartolomeo da Varignana, Peter of Argelata, Costanzo Varolio, Julius קיסר Aranzio, Gaspare Tagliaco) ובעשרים הראשונים של האנטומיסטים המפורסמים ביותר של המחקר. הכיסא של הקורא, המשקיף על זה של המפגין, מוקף בשני פסלים שנקראים "עור", שפוסלו בשנת 1734 לעיצוב של ארקול לי, אשר שימשו להמחשה של גוף האדם, כמו ספר פתוח. מעל החופה דמות נשית יושבת, אלגוריה של האנטומיה, מקבלת כמחווה מ putto מכונף לא פרח, אבל עצם ירך. החדר האנטומי נפגע קשות בהפצצה, שב-29 בינואר 1944 הרס אגף זה של הבניין ונבנה מחדש מיד לאחר המלחמה תוך שימוש חוזר בפסלי העץ המקוריים, למרבה המזל התאושש מההריסות. זהו אחד התיאטראות האנטומיים העתיקים ביותר שהשתמרו.
