ويكرس الحرم لشخصية سانتا مارغريتا ، راعية كورتونا والفرنسيسكان العالي ، والنشاط الثقافي والروحي اللاحق للفرنسيسكان المراقبة. عند وفاة القديس (22 فبراير 1297) تقرر بناء كنيسة على شرفها ، بجوار كنيسة سان باسيليو القديمة التي استعادتها مارغريتا نفسها بعد اختيارها كمكان للتكفير عن الذنب والصلاة. في عام 1304 تم بناء المبنى المقدس بالفعل ، لكنه استمر في تزيينه بلوحات جدارية مهمة طوال القرن الرابع عشر. لم يأت إلينا سوى عدد قليل من أجزاء هذه الدورة الجدارية في متحف الأبرشية ، ولكن تم الحفاظ على أدلة عليها في رمز من القرن السابع عشر يوثق مع واحد وعشرين مشاهد ملونة بالألوان المائية اللوحات الجدارية المفقودة في عام 1653 عندما ، بسبب حالة الحفظ السيئة ، تم غسلها بعيدا. يؤدي تحليل الأجزاء الباقية إلى تأريخها حوالي عام 1335 ونسبها إلى ورشة عمل أحد أو كلا الأخوين لورينزيتي. في عام 1385 ، تم تكليف الكنيسة بالرهبان الزيتونيين ، وحلت محلها في عام 1389 من قبل القصر الملتزمين الذين ما زالوا يعتنون بها ويرحبون بالزوار. في أغسطس 1927 تم رفعه إلى كرامة البازيليكا الصغرى.
