მალტის დედაქალაქში დარჩენა არ არის სრული წმინდა იოანეს ტაძრის მალტის მონახულების გარეშე. პროექტი 1572 წელს დაავალა დიდოსტატმა ჟან დე ლა კასიერმა, რათა ემსახურებოდეს წმინდა იოანეს რაინდების ორდენის ეკლესიას და დააპროექტა მალტელმა არქიტექტორმა ჯეროლამო კასარმა. სამუშაო დასრულდა 1577 წელს და მიეძღვნა წმინდა იოანე ნათლისმცემელს, ორდენის ორი მფარველი წმინდანიდან ერთ-ერთს. წმინდა იოანეს თანა-კათედრალი ვალეტაში ასახავს ქრისტიანობის მნიშვნელობას მალტაში. გარედან, მე-16 საუკუნის ეს ტაძარი შეიძლება ძალიან არ გამოიყურებოდეს, მაგრამ შეხედეთ შიგნით და ნამდვილი სიურპრიზი გელით. ტაძარი განახლდა მე-17 საუკუნეში და აქვს მდიდრული ბაროკოს დეკორი. მდიდარი ბაროკოს ხელოვნებისა და რელიქვიების გარდა, Co Cathedral ასევე შეიცავს შთამბეჭდავ ბაროკოს ფრესკებს, მორთული მარმარილოს იატაკებს, სამგანზომილებიან ქანდაკებებს, მოჩუქურთმებული ქვის კედლები და თვალწარმტაცი თაღოვანი ჭერი, რომლებიც მორთულია ცნობილი იტალიელი ბაროკოს მხატვრის, მატია პრეტის მიერ. თანა-კათედრალი ასევე არის მიქელანჯელო მერისი და კარავაჯოს ერთ-ერთი ყველაზე საერთაშორისოდ აღიარებული ნამუშევარი, რომელიც ცნობილია როგორც ‘წმინდა იოანე ნათლისმცემლის თავის მოკვეთა’ (1608 წ.). ნახატი, რომელიც მდებარეობს ორატორიაში, არის კარავაჯოს უდიდესი ხელოვნების ნიმუში და ერთადერთი, რომელსაც აქვს მისი ხელმოწერა. წელიწადის ყოველ დღე, მნახველები მიდიან ტაძრისკენ, რათა ნახონ ცნობილი ნამუშევრები და ბევრი ბრუნდება ტაძარში ყოველ ჯერზე, როცა ისინი კუნძულზე არიან. თავად ტაძარი შედგება ცხრა მჭევრმეტყველურად მორთული სამლოცველოსაგან ორივე მხარეს; რვა აშენდა წმინდა იოანეს რაინდების თითოეულ ენაზე, ხოლო მეცხრე ეძღვნება მათ მფარველ წმინდანს, ღვთისმშობელს ფილერმოსს, ორდენის მეორე მფარველ წმინდანს. ბოლო სამლოცველოში ასევე განთავსებულია ფილერმოსის ქალბატონის უძველესი ხატი, რომელსაც რაინდები წმინდა ობიექტად თვლიდნენ. წმინდა იოანეს საკათედრო ტაძარში მალტაში ასევე არის იდუმალი საძვალე, რომელიც შეიცავს წმინდა იოანეს რაინდების წინა დიდოსტატთა სამარხებს.
