La abadía de Farfa es uno de los monumentos más destacados de la Edad Media europea; contó con el patrocinio de Carlomagno y poseyó, en el momento de mayor esplendor, una vasta porción de Italia central. El origen de la abadía sigue siendo incierto, aunque las últimas excavaciones arqueológicas dirigidas por el profesor David Whitehouse, director de la escuela británica de Roma, han constatado la existencia de un complejo de época romana bajo la actual abadía. La identificación casi segura de Lorenzo Siro con el obispo de Forum Novum (Vescovio) en el año 554 permitiría constatar la creación de un ferviente centro de fe y riqueza en el siglo V. En la época de la invasión lombarda, había una basílica y algunos edificios monásticos. Según una leyenda, en los últimos veinte años del siglo VII, Tomás de Moriana (o Morienna), que vivía en Jerusalén, a raíz de una visión de la Virgen María, instó a buscar los restos de una basílica dedicada a ella en Sabina, en un dicho acutiano, reconstruyó la obra construida por el obispo Siro y dio lugar a una refundación de la comunidad. A principios del siglo VIII, el monasterio gozaba de la protección del duque de Spoleto Faroaldo II.
Farfa era, pues, una abadía imperial, libre del control papal pero muy cercana a la Santa Sede. En pocas décadas se convirtió en uno de los centros más conocidos y prestigiosos de la Europa medieval; el propio Carlomagno, unas semanas antes de ser coronado en el Capitolio, visitó la abadía y se alojó en ella. En el año 999 se introdujo la reforma nacida en Cluny. Con Bérard I (1047 - 1089), Farfa retomó las características de una abadía imperial y en la lucha por la investidura se puso en contra de los Papas y a favor de Enrique IV, por lo que, en 1097, los monjes decidieron, por razones de seguridad, trasladar el complejo abacial al monte Acucia, donde aún hoy son visibles las imponentes ruinas de la obra iniciada pero nunca terminada. Sin embargo, el declive definitivo comenzó poco después: el Concordato de Worms (1122) marcó el paso del monasterio a la autoridad papal; con el abad Adenolfo (1125), se sancionó oficialmente el sometimiento total.
En 1798 Farfa sufrió el saqueo de los franceses y en 1861 la confiscación del Estado italiano. Desde 1921, la abadía pertenece a la comunidad benedictina de San Pablo Extramuros. Una portada románica del siglo XIV (con añadidos góticos) da paso a un patio, en cuyo fondo se encuentra la iglesia abacial consagrada a la Virgen, que data de la segunda mitad del siglo XV. Obsérvese sobre el portal románico, en el luneto, un fresco del siglo XV. En los muros de la iglesia se distinguen fragmentos de sarcófagos paleocristianos. El interior de la basílica tiene una nave y dos pasillos divididos por dos filas de elegantes columnas jónicas, en la pared del fondo un gran óleo sobre pared que representa el Juicio Final pintado en 1561 por el pintor flamenco Henrik van der Broek. Frescos de los siglos XVI y XVII que representan Historias de la Virgen, Santos e Historias Bíblicas decoran el ábside y las naves menores, destacando en la primera capilla de la derecha una Crucifixión (copia de Francesco Trevisani), en la segunda una Virgen con el Niño y dos Ángeles conocida como la Virgen de Farfa, una venerada tabla del siglo XIII, recubierta (en el siglo XIX) con una lámina de latón repujado que sólo deja visibles los rostros. Cerca de la puerta de la basílica, en el crucero y en el ábside, han salido a la luz interesantes restos: un altar de la época carolingia y una sección de la pared pintada al fresco con la imagen de un abad (el llamado Arcosollo di Altperto), que el profesor Whitehouse, leyendo detenidamente el fragmento de escritura conservado, ha identificado recientemente como San Lorenzo Siro. En las tres capillas de la nave izquierda trabajaron Orazio Gentileschi y sus alumnos. De hecho, los tres lienzos que representan a Santa Úrsula (capilla I), la Virgen con el Niño (capilla II) y la Crucifixión de San Pedro (capilla III) son obra del maestro, y los frescos que decoran el interior de las capillas y que representan episodios de la historia sagrada son obra de sus alumnos. En el crucero, el suelo original de la primera mitad del siglo IX es parcialmente visible. En la capilla izquierda del crucero destacan las severas imágenes de los fundadores de la Abadía de Farfa: Santo Tomás de Morienna y San Lorenzo Siro. En el techo del crucero y en el coro, hay que observar con atención los inusuales (para un lugar sagrado) grotescos de la escuela Zuccari. El coro de madera del ábside es de principios del siglo XVII. Antes de salir de la iglesia, mirando hacia arriba, se puede admirar el artesonado de 1494 con el escudo de los Orsini en un panel en el centro de la nave. También merece la pena visitar la cripta semicircular de los siglos VII-VIII, en cuyo atrio hay un bello sarcófago romano (finales del siglo II d.C.) con una escena de batalla entre romanos y bárbaros, y el campanario (siglos IX-XIII), en cuya base, en una cámara cuadrada, se pueden ver, aunque deteriorados, unos frescos muy interesantes de la escuela romana de mediados del siglo XI, que representan historias bíblicas y la Ascensión. Subiendo a las salas superiores, en una de ellas, pintada al fresco en un sottareo, se encuentran unos Profetas pintados en el siglo XV.
La visita a la abadía puede completarse solicitando que se le acompañe al Chiostrino Longobardo (con una ventana románica con parteluz del siglo XIII) y al Chiostro grande (claustro grande) de la segunda mitad del siglo XVII, donde se recogen esculturas y epígrafes romanos; desde aquí, a través de un portal de punta de diamante, se pasa a la actual biblioteca con más de 45.000 volúmenes, donde se encuentran algunos códices de gran valor.