Assisi Püha Franciscuse kirik Linnapalee kõrval asuv kirik oli algselt frantsiskaani kloostri osa. 1615. aastal kirik ümber ehitati ja osaliselt ümber ehitati. Seitsmeteistkümnenda sajandi teisel poolel renoveerisid Frantsiskaanid pärast kloostri taastamist kiriku Meistrite ja skulptorite juhtimisel: Giuseppe Fasano ja Nicolantonio maldarella.