Gereja berdiri di puncak bukit di lokasi yang indah. Di tempat gereja sekarang ada sebuah gereja kecil dibangun oleh biarawan Camaldolese pada abad XI dan didedikasikan untuk Saint Basil. Gereja rusak selama Cortona 1258 dan dibangun kembali pada tahun 1288 oleh Santa Margherita oleh St Basil, St Egidio dan St Catherine dari Alexandria. Saint Margaret, di sebuah ruangan di belakang gereja kecil ini menjalani tahun-tahun terakhir hidupnya dan meninggal di sana pada tahun 1297. Dia dimakamkan di Gereja St Basil. Segera setelah kematian Margherita cortonesi, di samping gereja, membangun gereja yang lebih besar untuk didesain oleh Giovanni Pisano dan pada 1330 memindahkan tubuh orang Suci. Dari empat belas abad bangunan tetap hanya jendela mawar di bagian depan, menara lonceng dan dinding eksternal paduan suara. Sepanjang abad ke-empat gereja terus dibuat-buat dengan lukisan dinding penting. Dari siklus mural ini telah datang kepada kami hanya beberapa fragmen yang diawetkan di Museum Diocesan, tetapi bukti itu diawetkan dalam kode dari abad ketujuh belas bahwa dokumen dengan dua puluh satu adegan basah di dinding lukisan dinding yang hilang pada tahun 1653 ketika, karena negara miskin konservasi mereka dicuci pergi. Analisis fragmen yang hidup mengarah ke tanggal mereka sekitar 1335 dan atribut mereka ke bengkel satu atau kedua saudara Lorenzetti. Pada 1385 ... gereja dipercayakan kepada para biarawan Olivetan, digantikan tahun 1389 oleh para pengamat yang masih mengurus itu dan menyambut pengunjung. Gereja telah mengalah transformasi di era modern, yang tujuh belas-abad altars tetap, tapi transformasi yang paling penting, tapi benar-benar menghilang, adalah salah satu yang diinginkan di tengah-tengah '700 oleh John V, Raja Portugal, yang telah menerima kasih karunia dari Santo. Gereja sekarang adalah akibat dari rekonstruksi nineteen-century, dipercayakan terlebih dahulu terhadap arsitek Enrico Presententi, yang menggantikan satu nave asli dengan struktur basilano, kemudian pada Arsitek Mariano, Falcini yang menyelesaikan bangunan suci tanpa menyenangkan orang-orang tersebut. Oleh karena itu, pada tahun 1896, Giuseppe Castellucci telah ditugaskan untuk mengulang fasadenya, yang ada di mata, jendela mawar abad keempat dari gereja tua yang rusak. Pada bulan Agustus 1927 itu diangkat menjadi martabat basilica Minor. Dalam kapel transeptisur kiri adalah marmer abad empat sepulchral monumen santa Margherita; yang dimuliakan sisa di guci perak (1646) di Altar tinggi.