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El Museo de Ciencias Naturales Enrico Caffi de Bérgamo, situado en la Ciudad Alta de la Ciudadela, cerca del Museo Arqueológico Cívico de Bérgamo, "alberga colecciones referidas a todas las disciplinas naturalistas, conserva más de un millón de hallazgos y tiene una superficie de exposición de más de 1.800 m². El primer núcleo del Museo se remonta a 1871 y está formado por las colecciones didácticas naturalistas del Real Instituto Técnico "Vittorio Emanuele II". En 1918 el Museo se convirtió en cívico. Las colecciones dedicadas a las Ciencias de la Tierra incluyen en gran medida hallazgos de la zona de Bérgamo e incluyen colecciones de minerales, piedras ornamentales y de construcción. Las colecciones paleontológicas incluyen más de 55.000 hallazgos: el núcleo principal está formado por fósiles procedentes del territorio orobio. Por último, las colecciones zoológicas son importantes.
